RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519767.5

VEGFA-220, Transcript of vascular endothelial growth factor A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VEGFA, Length 970 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFA-220ENST00000519767 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.65■■■■■ 7.62
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VEGFA-220ENST00000519767 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.18■■■■■ 6.1
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VEGFA-220ENST00000519767 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.88■■■■■ 6.06
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VEGFA-220ENST00000519767 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.27■■■■■ 5.64
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VEGFA-220ENST00000519767 NCAPD3P42695 1498 aa48.93■■■■■ 5.42
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VEGFA-220ENST00000519767 SMARCA2P51531 1590 aa48.66■■■■■ 5.38
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VEGFA-220ENST00000519767 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.22■■■■■ 5.31
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VEGFA-220ENST00000519767 NESP48681 1621 aa47.89■■■■■ 5.26
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VEGFA-220ENST00000519767 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.51■■■■■ 5.2
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VEGFA-220ENST00000519767 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.86■■■■■ 5.09
VEGFA-220ENST00000519767 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.85■■■■■ 5.09
VEGFA-220ENST00000519767 WDR62O43379 1518 aa46.79■■■■■ 5.08
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VEGFA-220ENST00000519767 IFT140Q96RY7 1462 aa45.96■■■■■ 4.95
VEGFA-220ENST00000519767 OSCARQ8IYS5 282 aa45.94■■■■■ 4.94
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VEGFA-220ENST00000519767 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.29■■■■■ 4.84
VEGFA-220ENST00000519767 CUX1P39880 1505 aa45.28■■■■■ 4.84
VEGFA-220ENST00000519767 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
VEGFA-220ENST00000519767 FBLN2P98095 1184 aa45.18■■■■■ 4.82
VEGFA-220ENST00000519767 WDR97A6NE52 1622 aa45.12■■■■■ 4.81
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VEGFA-220ENST00000519767 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.01■■■■■ 4.8
VEGFA-220ENST00000519767 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.01■■■■■ 4.8
VEGFA-220ENST00000519767 CHD1O14646 1710 aa44.98■■■■■ 4.79
VEGFA-220ENST00000519767 ARHGEF11O15085 1522 aa44.97■■■■■ 4.79
VEGFA-220ENST00000519767 GRIN2BQ13224 1484 aa44.97■■■■■ 4.79
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VEGFA-220ENST00000519767 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.94■■■■■ 4.78
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VEGFA-220ENST00000519767 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.84■■■■■ 4.77
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VEGFA-220ENST00000519767 TOP2BQ02880 1626 aa44.66■■■■■ 4.74
VEGFA-220ENST00000519767 SYNJ1O43426 1573 aa44.65■■■■■ 4.74
VEGFA-220ENST00000519767 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.62■■■■■ 4.73
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VEGFA-220ENST00000519767 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.58■■■■■ 4.73
VEGFA-220ENST00000519767 ARAP1Q96P48 1450 aa44.53■■■■■ 4.72
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VEGFA-220ENST00000519767 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.33■■■■■ 4.69
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VEGFA-220ENST00000519767 ADAMTS12P58397 1594 aa44.26■■■■■ 4.68
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VEGFA-220ENST00000519767 CEP170Q5SW79 1584 aa44.07■■■■■ 4.65
VEGFA-220ENST00000519767 KIF27Q86VH2 1401 aa43.94■■■■■ 4.62
VEGFA-220ENST00000519767 IGF1RP08069 1367 aa43.9■■■■■ 4.62
VEGFA-220ENST00000519767 JPH4Q96JJ6 628 aa43.88■■■■■ 4.62
VEGFA-220ENST00000519767 SHROOM2Q13796 1616 aa43.86■■■■■ 4.61
VEGFA-220ENST00000519767 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.86■■■■■ 4.61
VEGFA-220ENST00000519767 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
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