RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476772.5

VEGFA-211, Transcript of vascular endothelial growth factor A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VEGFA, Length 1,683 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFA-211ENST00000476772 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.38■■■■■ 8.22
VEGFA-211ENST00000476772 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.11■■■■■ 6.89
VEGFA-211ENST00000476772 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.7■■■■■ 6.51
VEGFA-211ENST00000476772 ABCC9O60706 1549 aa55.28■■■■■ 6.44
VEGFA-211ENST00000476772 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.88■■■■■ 6.38
VEGFA-211ENST00000476772 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.88■■■■■ 6.38
VEGFA-211ENST00000476772 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.37■■■■■ 6.3
VEGFA-211ENST00000476772 NACADO15069 1562 aa54.18■■■■■ 6.26
VEGFA-211ENST00000476772 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.86■■■■■ 6.21
VEGFA-211ENST00000476772 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.83■■■■■ 6.21
VEGFA-211ENST00000476772 SCRIBQ14160 1630 aa53.38■■■■■ 6.14
VEGFA-211ENST00000476772 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.78■■■■■ 6.04
VEGFA-211ENST00000476772 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.23■■■■■ 5.95
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VEGFA-211ENST00000476772 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.62■■■■■ 5.85
VEGFA-211ENST00000476772 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.58■■■■■ 5.85
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VEGFA-211ENST00000476772 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.28■■■■■ 5.8
VEGFA-211ENST00000476772 SMARCA4P51532 1647 aa51.14■■■■■ 5.78
VEGFA-211ENST00000476772 WIZO95785 1651 aa50.86■■■■■ 5.73
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VEGFA-211ENST00000476772 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.52■■■■■ 5.68
VEGFA-211ENST00000476772 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.38■■■■■ 5.65
VEGFA-211ENST00000476772 SMARCA2P51531 1590 aa50.34■■■■■ 5.65
VEGFA-211ENST00000476772 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.65
VEGFA-211ENST00000476772 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.07■■■■■ 5.61
VEGFA-211ENST00000476772 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.04■■■■■ 5.6
VEGFA-211ENST00000476772 NCAPD3P42695 1498 aa49.99■■■■■ 5.59
VEGFA-211ENST00000476772 HMGXB3Q12766 1538 aa49.93■■■■■ 5.58
VEGFA-211ENST00000476772 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.77■■■■■ 5.56
VEGFA-211ENST00000476772 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.17■■■■■ 5.46
VEGFA-211ENST00000476772 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.08■■■■■ 5.45
VEGFA-211ENST00000476772 CFTRP13569 1480 aa48.78■■■■■ 5.4
VEGFA-211ENST00000476772 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.67■■■■■ 5.38
VEGFA-211ENST00000476772 ABCC8Q09428 1581 aa48.62■■■■■ 5.37
VEGFA-211ENST00000476772 PRDM2Q13029 1718 aa48.57■■■■■ 5.37
VEGFA-211ENST00000476772 TRIM41Q8WV44 630 aa48.52■■■■■ 5.36
VEGFA-211ENST00000476772 NESP48681 1621 aa48.42■■■■■ 5.34
VEGFA-211ENST00000476772 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.38■■■■■ 5.34
VEGFA-211ENST00000476772 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.33■■■■■ 5.332e-6■■■■■ 35.2
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VEGFA-211ENST00000476772 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.16■■■■■ 5.3
VEGFA-211ENST00000476772 TOP2BQ02880 1626 aa48.01■■■■■ 5.28
VEGFA-211ENST00000476772 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.99■■■■■ 5.27
VEGFA-211ENST00000476772 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.98■■■■■ 5.27
VEGFA-211ENST00000476772 CUX1P39880 1505 aa47.98■■■■■ 5.27
VEGFA-211ENST00000476772 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.91■■■■■ 5.26
VEGFA-211ENST00000476772 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.87■■■■■ 5.25
VEGFA-211ENST00000476772 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.68■■■■■ 5.22
VEGFA-211ENST00000476772 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.64■■■■■ 5.22
VEGFA-211ENST00000476772 TOPBP1Q92547 1522 aa47.61■■■■■ 5.21
VEGFA-211ENST00000476772 SOGA1O94964 1423 aa47.6■■■■■ 5.21
VEGFA-211ENST00000476772 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
VEGFA-211ENST00000476772 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.51■■■■■ 5.2
VEGFA-211ENST00000476772 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.46■■■■■ 5.19
VEGFA-211ENST00000476772 ERCC6Q03468 1493 aa47.43■■■■■ 5.18
VEGFA-211ENST00000476772 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.43■■■■■ 5.18
VEGFA-211ENST00000476772 EEA1Q15075 1411 aa47.4■■■■■ 5.18
VEGFA-211ENST00000476772 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.35■■■■■ 5.17
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VEGFA-211ENST00000476772 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.18■■■■■ 5.14
VEGFA-211ENST00000476772 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
VEGFA-211ENST00000476772 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.16■■■■■ 5.14
VEGFA-211ENST00000476772 KIF27Q86VH2 1401 aa47.13■■■■■ 5.14
VEGFA-211ENST00000476772 CUX2O14529 1486 aa47.12■■■■■ 5.13
VEGFA-211ENST00000476772 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.08■■■■■ 5.13
VEGFA-211ENST00000476772 WDR97A6NE52 1622 aa47.02■■■■■ 5.12
VEGFA-211ENST00000476772 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.98■■■■■ 5.11
VEGFA-211ENST00000476772 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.11
VEGFA-211ENST00000476772 KIF21BO75037 1637 aa46.85■■■■■ 5.09
VEGFA-211ENST00000476772 IFT140Q96RY7 1462 aa46.78■■■■■ 5.08
VEGFA-211ENST00000476772 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.76■■■■■ 5.08
VEGFA-211ENST00000476772 GOLGA3Q08378 1498 aa46.76■■■■■ 5.08
VEGFA-211ENST00000476772 IGF1RP08069 1367 aa46.74■■■■■ 5.07
VEGFA-211ENST00000476772 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
VEGFA-211ENST00000476772 PRXQ9BXM0 1461 aa46.72■■■■■ 5.07
VEGFA-211ENST00000476772 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.65■■■■■ 5.06
VEGFA-211ENST00000476772 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.64■■■■■ 5.06
VEGFA-211ENST00000476772 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.6■■■■■ 5.05
VEGFA-211ENST00000476772 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.55■■■■■ 5.04
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VEGFA-211ENST00000476772 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.5■■■■■ 5.03
VEGFA-211ENST00000476772 CUL7Q14999 1698 aa46.48■■■■■ 5.03
VEGFA-211ENST00000476772 PBRM1Q86U86 1689 aa46.47■■■■■ 5.03
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VEGFA-211ENST00000476772 GRIN2BQ13224 1484 aa46.34■■■■■ 5.01
VEGFA-211ENST00000476772 CEP162Q5TB80 1403 aa46.25■■■■■ 4.99
VEGFA-211ENST00000476772 ADAMTS12P58397 1594 aa46.18■■■■■ 4.98
VEGFA-211ENST00000476772 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.13■■■■■ 4.97
VEGFA-211ENST00000476772 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.11■■■■■ 4.97
VEGFA-211ENST00000476772 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
VEGFA-211ENST00000476772 CLIP1P30622 1438 aa45.98■■■■■ 4.95
VEGFA-211ENST00000476772 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.92■■■■■ 4.94
VEGFA-211ENST00000476772 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
VEGFA-211ENST00000476772 SYNJ2O15056 1496 aa45.83■■■■■ 4.93
VEGFA-211ENST00000476772 GRIN2AQ12879 1464 aa45.79■■■■■ 4.92
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