Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 38.5
UTP3Q9NQZ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.533e-8■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 FLOT1-212ENST00000487376 1583 ntTSL 520.28■□□□□ 0.843e-8■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 SREK1-201ENST00000284041 3751 ntTSL 1 (best)4.98□□□□□ -1.618e-7■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 CIRBP-237ENST00000592234 571 ntTSL 519.41■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.041e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.041e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF706-214ENST00000523146 476 ntTSL 55.37□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 SZRD1-205ENST00000472461 843 ntTSL 320■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 SZRD1-204ENST00000472351 791 ntTSL 415.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 SZRD1-207ENST00000475554 583 ntTSL 311.8□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 SZRD1-209ENST00000486763 549 ntTSL 411.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 38.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-228ENST00000464128 565 ntTSL 48.4□□□□□ -1.066e-6■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 TMUB1-206ENST00000488752 584 ntTSL 224.09■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 TMUB1-207ENST00000492838 550 ntTSL 511.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.862e-6■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2M-203ENST00000595957 734 ntTSL 215.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-211ENST00000485349 734 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 EPB41-213ENST00000636666 3642 ntTSL 57.44□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 38.3
UTP3Q9NQZ2 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 511.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 MARS-204ENST00000545888 2979 ntTSL 515.99■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 214.34□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 NOSIP-213ENST00000600019 1167 ntTSL 515.62■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 MPHOSPH8-201ENST00000361479 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-206ENST00000565345 790 ntTSL 520.1■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-203ENST00000563663 1787 ntTSL 515.74■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-207ENST00000566480 2476 ntTSL 513.38□□□□□ -0.274e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-204ENST00000563829 3162 ntTSL 213.1□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-212ENST00000569904 858 ntTSL 513.04□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 38.2
UTP3Q9NQZ2 TUBB4B-202ENST00000604929 2035 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 38.1
UTP3Q9NQZ2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 38.1
UTP3Q9NQZ2 CTNND1-238ENST00000534647 866 ntTSL 512.17□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 GABRE-208ENST00000483564 2747 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 PHKA2-202ENST00000464455 500 ntTSL 34.68□□□□□ -1.663e-8■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 HGS-212ENST00000575058 632 ntTSL 317.49■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 225.75■■□□□ 1.711e-9■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 212.54□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 LMNA-216ENST00000496738 2405 ntTSL 218.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 58.25□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 38
UTP3Q9NQZ2 VPS28-205ENST00000526204 2120 ntTSL 522.79■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-212ENST00000530836 1613 ntTSL 522.71■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-208ENST00000527797 1609 ntTSL 522.68■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-209ENST00000528142 1821 ntTSL 322.36■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-213ENST00000530983 2337 ntTSL 520.72■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-207ENST00000526977 2036 ntTSL 520.26■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-216ENST00000533806 650 ntTSL 313.83□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-214ENST00000531032 573 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 516.7■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 36.81□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-217ENST00000555176 531 ntTSL 53.96□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF2-209ENST00000470874 372 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 37.9
UTP3Q9NQZ2 ANGEL2-206ENST00000481918 851 ntTSL 218.01■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 37.8
UTP3Q9NQZ2 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 519.45■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 37.8
UTP3Q9NQZ2 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 37.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 37.8
UTP3Q9NQZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 37.8
UTP3Q9NQZ2 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 516.7■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 37.8
UTP3Q9NQZ2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 TRAM1-204ENST00000521049 872 ntTSL 517.36■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 321.2■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 418.47■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-204ENST00000548622 839 ntTSL 218.2■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 519.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.718e-8■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 35.48□□□□□ -1.531e-6■■■■■ 37.7
UTP3Q9NQZ2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 37.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3816.1 ms