Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.553e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.33e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 216.83■□□□□ 0.283e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-212ENST00000565733 772 ntTSL 315.56■□□□□ 0.083e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-205ENST00000475766 525 ntTSL 411.77□□□□□ -0.533e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-213ENST00000566395 824 ntTSL 37.67□□□□□ -1.183e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-210ENST00000564223 395 ntTSL 36.7□□□□□ -1.343e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 RSRP1-221ENST00000569495 901 ntTSL 25.76□□□□□ -1.493e-12■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.068e-10■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.918e-11■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.098e-11■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.198e-11■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 MKL2-210ENST00000574998 545 ntTSL 47□□□□□ -1.298e-11■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 MKL2-212ENST00000575768 389 ntTSL 34.09□□□□□ -1.758e-11■■□□□ 12.6
NOLC1Q14978 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.639e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 HINT1-206ENST00000508495 825 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.349e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 HINT1-209ENST00000513345 656 ntTSL 217.12■□□□□ 0.339e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 HINT1-207ENST00000511475 923 ntTSL 310.92□□□□□ -0.669e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 HINT1-203ENST00000506207 369 ntTSL 56.09□□□□□ -1.439e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 29.08□□□□□ -0.961e-32■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 C3-212ENST00000599899 1992 ntTSL 210.59□□□□□ -0.713e-68■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-323■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.414e-7■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 UBE2B-202ENST00000499038 682 ntTSL 36.3□□□□□ -1.44e-7■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 UBE2B-203ENST00000503080 657 ntTSL 26.14□□□□□ -1.434e-7■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.366e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-218ENST00000485400 1513 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-212ENST00000444411 640 ntTSL 216.5■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-207ENST00000434538 2164 ntTSL 214.41□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-219ENST00000495415 1879 ntTSL 514.18□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.099e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-217ENST00000607482 403 ntTSL 321.02■□□□□ 0.969e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.939e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.869e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-214ENST00000606788 3056 ntTSL 218.29■□□□□ 0.529e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.319e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-216ENST00000607212 590 ntTSL 416.24■□□□□ 0.199e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-211ENST00000606066 603 ntTSL 515.61■□□□□ 0.099e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-219ENST00000607841 571 ntTSL 215.61■□□□□ 0.099e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-218ENST00000607814 584 ntTSL 414.84□□□□□ -0.039e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 CTSA-212ENST00000606394 584 ntTSL 414.49□□□□□ -0.099e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 STT3A-215ENST00000531599 973 ntTSL 38.95□□□□□ -0.983e-17■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 STT3A-202ENST00000524639 582 ntTSL 26.12□□□□□ -1.433e-17■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 FLNB-205ENST00000466455 404 ntTSL 319.41■□□□□ 0.78e-12■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 C2-202ENST00000383177 1847 ntTSL 517.84■□□□□ 0.457e-7■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.287e-7■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.147e-7■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.637e-7■■□□□ 12.5
NOLC1Q14978 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.097e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.087e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.367e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 AC008443.1-204ENST00000417281 629 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.417e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 PSMB3-207ENST00000610434 510 ntTSL 311.93□□□□□ -0.57e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.753e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 AC008443.1-205ENST00000599439 1868 nt9.49□□□□□ -0.897e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 39.12□□□□□ -0.957e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 27.71□□□□□ -1.187e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.259e-8■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 DLD-203ENST00000417551 2041 ntTSL 54.35□□□□□ -1.719e-8■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 FUBP1-201ENST00000294623 2201 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.377e-12■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.187e-12■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.137e-12■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.717e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.367e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.64□□□□□ -1.512e-27■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 RPS8-205ENST00000474582 391 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.41e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 IGF2R-205ENST00000487607 359 ntTSL 29.25□□□□□ -0.932e-7■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.71e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.441e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-206ENST00000518444 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-208ENST00000520064 2068 ntTSL 513.01□□□□□ -0.331e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-204ENST00000429001 4000 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.511e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.391e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.531e-323■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.084e-11■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-11■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-11■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 SCAP-212ENST00000487942 543 ntTSL 38.15□□□□□ -1.13e-6■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 GANAB-214ENST00000534613 737 ntTSL 517.03■□□□□ 0.322e-11■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 GANAB-213ENST00000534422 702 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-11■■□□□ 12.4
NOLC1Q14978 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-6■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 221.17■□□□□ 0.981e-6■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 219.86■□□□□ 0.771e-6■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 RHOT2-220ENST00000569197 530 ntTSL 513.09□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.28e-7■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.548e-7■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.68e-7■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.628e-7■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 321.73■■□□□ 1.071e-19■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 CTNNB1-206ENST00000431914 634 ntTSL 412.34□□□□□ -0.431e-7■■□□□ 12.3
NOLC1Q14978 CTNNB1-208ENST00000441708 608 ntTSL 410.04□□□□□ -0.81e-7■■□□□ 12.3
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 110.8 ms