RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243189.11

RSRP1-201, Transcript of arginine and serine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RSRP1, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1-201ENST00000243189 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.07■■■■■ 4
RSRP1-201ENST00000243189 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.33■■■■□ 3.25
RSRP1-201ENST00000243189 ABCC9O60706 1549 aa34.19■■■■□ 3.06
RSRP1-201ENST00000243189 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
RSRP1-201ENST00000243189 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.36■■■□□ 2.93
RSRP1-201ENST00000243189 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.15■■■□□ 2.9
RSRP1-201ENST00000243189 NACADO15069 1562 aa33.14■■■□□ 2.9
RSRP1-201ENST00000243189 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.1■■■□□ 2.89
RSRP1-201ENST00000243189 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.06■■■□□ 2.88
RSRP1-201ENST00000243189 SCRIBQ14160 1630 aa32.33■■■□□ 2.77
RSRP1-201ENST00000243189 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.26■■■□□ 2.75
RSRP1-201ENST00000243189 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.724e-9■■■□□ 17.7
RSRP1-201ENST00000243189 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.04■■■□□ 2.72
RSRP1-201ENST00000243189 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.01■■■□□ 2.71
RSRP1-201ENST00000243189 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.18■■■□□ 2.58
RSRP1-201ENST00000243189 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
RSRP1-201ENST00000243189 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
RSRP1-201ENST00000243189 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.96■■■□□ 2.55
RSRP1-201ENST00000243189 SMARCA4P51532 1647 aa30.96■■■□□ 2.55
RSRP1-201ENST00000243189 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.92■■■□□ 2.54
RSRP1-201ENST00000243189 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.9■■■□□ 2.54
RSRP1-201ENST00000243189 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
RSRP1-201ENST00000243189 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.71■■■□□ 2.51
RSRP1-201ENST00000243189 SMARCA2P51531 1590 aa30.66■■■□□ 2.5
RSRP1-201ENST00000243189 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.65■■■□□ 2.5
RSRP1-201ENST00000243189 NCAPD3P42695 1498 aa30.61■■■□□ 2.49
RSRP1-201ENST00000243189 WIZO95785 1651 aa30.57■■■□□ 2.48
RSRP1-201ENST00000243189 HMGXB3Q12766 1538 aa30.47■■■□□ 2.47
RSRP1-201ENST00000243189 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
RSRP1-201ENST00000243189 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
RSRP1-201ENST00000243189 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
RSRP1-201ENST00000243189 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.94■■■□□ 2.38
RSRP1-201ENST00000243189 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.76■■■□□ 2.35
RSRP1-201ENST00000243189 NESP48681 1621 aa29.73■■■□□ 2.35
RSRP1-201ENST00000243189 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.69■■■□□ 2.34
RSRP1-201ENST00000243189 CFTRP13569 1480 aa29.67■■■□□ 2.34
RSRP1-201ENST00000243189 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.51■■■□□ 2.31
RSRP1-201ENST00000243189 ERCC6Q03468 1493 aa29.43■■■□□ 2.3
RSRP1-201ENST00000243189 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.41■■■□□ 2.3
RSRP1-201ENST00000243189 PRDM2Q13029 1718 aa29.38■■■□□ 2.29
RSRP1-201ENST00000243189 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.33■■■□□ 2.29
RSRP1-201ENST00000243189 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.32■■■□□ 2.28
RSRP1-201ENST00000243189 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.16■■■□□ 2.26
RSRP1-201ENST00000243189 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
RSRP1-201ENST00000243189 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RSRP1-201ENST00000243189 WDR62O43379 1518 aa29.04■■■□□ 2.24
RSRP1-201ENST00000243189 ABCC8Q09428 1581 aa29■■■□□ 2.23
RSRP1-201ENST00000243189 TOPBP1Q92547 1522 aa28.98■■■□□ 2.23
RSRP1-201ENST00000243189 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.97■■■□□ 2.23
RSRP1-201ENST00000243189 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
RSRP1-201ENST00000243189 CUX1P39880 1505 aa28.95■■■□□ 2.22
RSRP1-201ENST00000243189 CUX2O14529 1486 aa28.91■■■□□ 2.22
RSRP1-201ENST00000243189 SYNJ1O43426 1573 aa28.84■■■□□ 2.21
RSRP1-201ENST00000243189 TOP2BQ02880 1626 aa28.81■■■□□ 2.2
RSRP1-201ENST00000243189 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.78■■■□□ 2.2
RSRP1-201ENST00000243189 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
RSRP1-201ENST00000243189 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.78■■■□□ 2.2
RSRP1-201ENST00000243189 SOGA1O94964 1423 aa28.69■■■□□ 2.18
RSRP1-201ENST00000243189 IFT140Q96RY7 1462 aa28.68■■■□□ 2.18
RSRP1-201ENST00000243189 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.66■■■□□ 2.18
RSRP1-201ENST00000243189 TRIM41Q8WV44 630 aa28.66■■■□□ 2.18
RSRP1-201ENST00000243189 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.63■■■□□ 2.17
RSRP1-201ENST00000243189 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
RSRP1-201ENST00000243189 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
RSRP1-201ENST00000243189 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.52■■■□□ 2.16
RSRP1-201ENST00000243189 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
RSRP1-201ENST00000243189 WDR97A6NE52 1622 aa28.45■■■□□ 2.14
RSRP1-201ENST00000243189 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.143e-8■■■■■ 28.7
RSRP1-201ENST00000243189 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
RSRP1-201ENST00000243189 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.35■■■□□ 2.13
RSRP1-201ENST00000243189 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.33■■■□□ 2.13
RSRP1-201ENST00000243189 KIF27Q86VH2 1401 aa28.33■■■□□ 2.13
RSRP1-201ENST00000243189 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
RSRP1-201ENST00000243189 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.23■■■□□ 2.11
RSRP1-201ENST00000243189 PBRM1Q86U86 1689 aa28.19■■■□□ 2.1
RSRP1-201ENST00000243189 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.18■■■□□ 2.1
RSRP1-201ENST00000243189 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.18■■■□□ 2.1
RSRP1-201ENST00000243189 IGF1RP08069 1367 aa28.17■■■□□ 2.1
RSRP1-201ENST00000243189 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
RSRP1-201ENST00000243189 EEA1Q15075 1411 aa28.1■■■□□ 2.09
RSRP1-201ENST00000243189 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
RSRP1-201ENST00000243189 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.04■■■□□ 2.08
RSRP1-201ENST00000243189 FBLN2P98095 1184 aa28.03■■■□□ 2.08
RSRP1-201ENST00000243189 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.03■■■□□ 2.08
RSRP1-201ENST00000243189 ADAMTS12P58397 1594 aa28.03■■■□□ 2.08
RSRP1-201ENST00000243189 SYNJ2O15056 1496 aa28.03■■■□□ 2.08
RSRP1-201ENST00000243189 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
RSRP1-201ENST00000243189 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.01■■■□□ 2.07
RSRP1-201ENST00000243189 CUL7Q14999 1698 aa27.99■■■□□ 2.07
RSRP1-201ENST00000243189 GRIN2AQ12879 1464 aa27.91■■■□□ 2.06
RSRP1-201ENST00000243189 CHD1O14646 1710 aa27.91■■■□□ 2.06
RSRP1-201ENST00000243189 PRXQ9BXM0 1461 aa27.9■■■□□ 2.06
RSRP1-201ENST00000243189 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.88■■■□□ 2.05
RSRP1-201ENST00000243189 OSCARQ8IYS5 282 aa27.86■■■□□ 2.05
RSRP1-201ENST00000243189 NUP160Q12769 1436 aa27.77■■■□□ 2.04
RSRP1-201ENST00000243189 KIF21BO75037 1637 aa27.74■■■□□ 2.03
RSRP1-201ENST00000243189 CEP170Q5SW79 1584 aa27.73■■■□□ 2.03
RSRP1-201ENST00000243189 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.68■■■□□ 2.02
RSRP1-201ENST00000243189 GOLGA3Q08378 1498 aa27.65■■■□□ 2.02
RSRP1-201ENST00000243189 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms