RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.32■■■■■ 5.01
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UBE2B-201ENST00000265339 ABCC9O60706 1549 aa38.75■■■■□ 3.79
UBE2B-201ENST00000265339 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.31■■■■□ 3.72
UBE2B-201ENST00000265339 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.3■■■■□ 3.72
UBE2B-201ENST00000265339 MYO15BQ96JP2 1530 aa38■■■■□ 3.67
UBE2B-201ENST00000265339 NACADO15069 1562 aa37.9■■■■□ 3.66
UBE2B-201ENST00000265339 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.68■■■■□ 3.62
UBE2B-201ENST00000265339 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.47■■■■□ 3.59
UBE2B-201ENST00000265339 SCRIBQ14160 1630 aa37.29■■■■□ 3.56
UBE2B-201ENST00000265339 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.96■■■■□ 3.51
UBE2B-201ENST00000265339 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.58■■■■□ 3.45
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UBE2B-201ENST00000265339 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.03■■■■□ 3.36
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UBE2B-201ENST00000265339 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
UBE2B-201ENST00000265339 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.79■■■■□ 3.32
UBE2B-201ENST00000265339 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
UBE2B-201ENST00000265339 SMARCA4P51532 1647 aa35.72■■■■□ 3.31
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
UBE2B-201ENST00000265339 WIZO95785 1651 aa35.48■■■■□ 3.27
UBE2B-201ENST00000265339 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.3■■■■□ 3.24
UBE2B-201ENST00000265339 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.21■■■■□ 3.23
UBE2B-201ENST00000265339 SMARCA2P51531 1590 aa35.18■■■■□ 3.22
UBE2B-201ENST00000265339 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
UBE2B-201ENST00000265339 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.08■■■■□ 3.21
UBE2B-201ENST00000265339 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
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UBE2B-201ENST00000265339 HMGXB3Q12766 1538 aa34.92■■■■□ 3.18
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.71■■■■□ 3.15
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.52■■■■□ 3.12
UBE2B-201ENST00000265339 CFTRP13569 1480 aa34.09■■■■□ 3.05
UBE2B-201ENST00000265339 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.06■■■■□ 3.04
UBE2B-201ENST00000265339 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.03■■■■□ 3.04
UBE2B-201ENST00000265339 PRDM2Q13029 1718 aa33.95■■■■□ 3.03
UBE2B-201ENST00000265339 NESP48681 1621 aa33.9■■■■□ 3.02
UBE2B-201ENST00000265339 ABCC8Q09428 1581 aa33.87■■■■□ 3.01
UBE2B-201ENST00000265339 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.87■■■■□ 3.01
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM41Q8WV44 630 aa33.69■■■□□ 2.98
UBE2B-201ENST00000265339 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.67■■■□□ 2.98
UBE2B-201ENST00000265339 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.67■■■□□ 2.98
UBE2B-201ENST00000265339 SYNJ1O43426 1573 aa33.6■■■□□ 2.97
UBE2B-201ENST00000265339 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.58■■■□□ 2.97
UBE2B-201ENST00000265339 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.52■■■□□ 2.96
UBE2B-201ENST00000265339 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.51■■■□□ 2.95
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UBE2B-201ENST00000265339 TOP2BQ02880 1626 aa33.48■■■□□ 2.95
UBE2B-201ENST00000265339 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.47■■■□□ 2.95
UBE2B-201ENST00000265339 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.32■■■□□ 2.92
UBE2B-201ENST00000265339 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
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UBE2B-201ENST00000265339 ERCC6Q03468 1493 aa33.25■■■□□ 2.91
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UBE2B-201ENST00000265339 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.18■■■□□ 2.9
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UBE2B-201ENST00000265339 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
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UBE2B-201ENST00000265339 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.96■■■□□ 2.87
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UBE2B-201ENST00000265339 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.87■■■□□ 2.85
UBE2B-201ENST00000265339 CUX2O14529 1486 aa32.87■■■□□ 2.85
UBE2B-201ENST00000265339 WDR97A6NE52 1622 aa32.86■■■□□ 2.85
UBE2B-201ENST00000265339 KIF27Q86VH2 1401 aa32.84■■■□□ 2.85
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UBE2B-201ENST00000265339 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.78■■■□□ 2.84
UBE2B-201ENST00000265339 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.74■■■□□ 2.83
UBE2B-201ENST00000265339 IFT140Q96RY7 1462 aa32.72■■■□□ 2.83
UBE2B-201ENST00000265339 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.67■■■□□ 2.82
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UBE2B-201ENST00000265339 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.62■■■□□ 2.81
UBE2B-201ENST00000265339 KIF21BO75037 1637 aa32.59■■■□□ 2.81
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UBE2B-201ENST00000265339 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.58■■■□□ 2.81
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
UBE2B-201ENST00000265339 PRXQ9BXM0 1461 aa32.54■■■□□ 2.8
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UBE2B-201ENST00000265339 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.48■■■□□ 2.79
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UBE2B-201ENST00000265339 GRIN2BQ13224 1484 aa32.39■■■□□ 2.78
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UBE2B-201ENST00000265339 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
UBE2B-201ENST00000265339 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.29■■■□□ 2.76
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS12P58397 1594 aa32.28■■■□□ 2.76
UBE2B-201ENST00000265339 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
UBE2B-201ENST00000265339 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.25■■■□□ 2.75
UBE2B-201ENST00000265339 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.22■■■□□ 2.75
UBE2B-201ENST00000265339 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
UBE2B-201ENST00000265339 CEP162Q5TB80 1403 aa32.11■■■□□ 2.73
UBE2B-201ENST00000265339 SYNJ2O15056 1496 aa32.05■■■□□ 2.72
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