Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 MORC3-208ENST00000547657 750 ntTSL 25.69□□□□□ -1.51e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 MORC3-210ENST00000551367 513 ntTSL 25.31□□□□□ -1.561e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.399e-26■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 ATP6V0A1-218ENST00000588629 1797 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-7■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.944e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TTC3-216ENST00000479930 8998 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.974e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 LSM8-202ENST00000411938 290 ntTSL 38.14□□□□□ -1.114e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 ATP6V0A1-215ENST00000587824 554 ntTSL 47.85□□□□□ -1.153e-7■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TTC3-215ENST00000476784 7425 ntTSL 26.69□□□□□ -1.344e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.44e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 NAA15-204ENST00000480277 852 ntTSL 36.1□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.624e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TTC3-214ENST00000472398 2305 ntTSL 1 (best)3.33□□□□□ -1.884e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CLNS1A-209ENST00000527299 387 ntTSL 25.09□□□□□ -1.592e-12■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 BRD7-207ENST00000569774 416 ntTSL 39.35□□□□□ -0.912e-10■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.591e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.821e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.861e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 27.55□□□□□ -1.21e-11■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 UBN1-206ENST00000587027 837 ntTSL 313.56□□□□□ -0.242e-7■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.322e-7■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-219ENST00000608720 2241 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.184e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-213ENST00000607923 2964 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.314e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-203ENST00000422109 2964 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.314e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.474e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.484e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.594e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-209ENST00000433949 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-220ENST00000608858 905 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.664e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-221ENST00000608903 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.74e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-214ENST00000608108 1628 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.744e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-212ENST00000539382 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.754e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 CTCFL-206ENST00000426658 3996 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.864e-9■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 EIF3G-210ENST00000590158 1034 ntTSL 216.21■□□□□ 0.193e-6■■□□□ 13.1
PUM1Q14671 KMT2C-206ENST00000424877 5874 ntTSL 55.76□□□□□ -1.495e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 KMT2C-203ENST00000360104 11186 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.575e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 KMT2C-208ENST00000473186 12854 ntTSL 1 (best)4.13□□□□□ -1.755e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 HDLBP-226ENST00000453141 997 ntTSL 38.02□□□□□ -1.133e-11■■□□□ 13
PUM1Q14671 PANK4-205ENST00000486396 879 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 PANK4-202ENST00000435556 2524 ntTSL 216.15■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 517.02■□□□□ 0.329e-7■■□□□ 13
PUM1Q14671 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.239e-7■■□□□ 13
PUM1Q14671 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.039e-7■■□□□ 13
PUM1Q14671 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 513.89□□□□□ -0.199e-7■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.962e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 220.78■□□□□ 0.922e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 520.51■□□□□ 0.872e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 320.4■□□□□ 0.862e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 418.86■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 418.86■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 318.42■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 217.19■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-244ENST00000532952 773 ntTSL 315.22■□□□□ 0.032e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 412.23□□□□□ -0.452e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 320.73■□□□□ 0.912e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 520.73■□□□□ 0.912e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 519.26■□□□□ 0.672e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 319.26■□□□□ 0.672e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-202ENST00000547250 840 ntTSL 59.24□□□□□ -0.932e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-209ENST00000551570 399 ntTSL 38.08□□□□□ -1.122e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.47□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 HSP90AB2P-202ENST00000602906 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.998e-16■■□□□ 13
PUM1Q14671 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC7.36□□□□□ -1.238e-16■■□□□ 13
PUM1Q14671 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.266e-7■■□□□ 13
PUM1Q14671 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.068e-7■■□□□ 13
PUM1Q14671 CCAR1-216ENST00000543706 869 ntTSL 57.7□□□□□ -1.183e-11■■□□□ 13
PUM1Q14671 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 23.95□□□□□ -1.783e-11■■□□□ 13
PUM1Q14671 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.144e-12■■□□□ 13
PUM1Q14671 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-12■■□□□ 13
PUM1Q14671 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.454e-12■■□□□ 13
PUM1Q14671 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-12■■□□□ 13
PUM1Q14671 NAT10-208ENST00000532555 615 ntTSL 26.53□□□□□ -1.363e-9■■□□□ 13
PUM1Q14671 RAD21-209ENST00000523547 908 ntTSL 323.75■■□□□ 1.392e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 CACYBP-207ENST00000473925 804 ntTSL 222.6■■□□□ 1.216e-14■■□□□ 13
PUM1Q14671 RAD21-208ENST00000522699 548 ntTSL 318.49■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.389e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.359e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.279e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.269e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.269e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 LDHB-210ENST00000544151 544 ntTSL 216.32■□□□□ 0.29e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.27e-7■■□□□ 13
PUM1Q14671 RAD21-202ENST00000517485 874 ntTSL 315.64■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.089e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 NRBP1-205ENST00000419281 674 ntTSL 315.19■□□□□ 0.029e-8■■□□□ 13
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 196.4 ms