Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ITGAE-207ENST00000572179 672 ntTSL 1 (best)14.33□□□□□ -0.124e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 COG3-207ENST00000618913 530 nt14.33□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TOP1MT-203ENST00000517857 624 ntTSL 214.06□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.175e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LITAF-208ENST00000571627 579 ntTSL 413.85□□□□□ -0.194e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 MBD1-226ENST00000591661 482 ntTSL 313.83□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.235e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TRMT2A-214ENST00000480460 378 ntTSL 313.51□□□□□ -0.255e-22■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-213ENST00000514636 544 ntTSL 313.35□□□□□ -0.273e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.274e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 MYDGF-202ENST00000596031 335 ntTSL 313.23□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SSBP1-206ENST00000467681 630 ntTSL 213.15□□□□□ -0.34e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-209ENST00000511171 4870 ntTSL 213.1□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 RCC1-211ENST00000478232 509 ntTSL 212.87□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 COG3-203ENST00000476702 255 ntTSL 312.81□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.375e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SEPT9-209ENST00000585638 565 ntTSL 412.67□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-213ENST00000548697 587 ntTSL 512.45□□□□□ -0.423e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.433e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.455e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-206ENST00000518444 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 412.09□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-207ENST00000508327 1306 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-220ENST00000514830 802 ntTSL 211.81□□□□□ -0.525e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 411.79□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PAPSS1-207ENST00000514489 579 ntTSL 411.73□□□□□ -0.533e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TRPV2-202ENST00000455666 796 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 C8orf58-204ENST00000475994 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.6□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-208ENST00000504489 538 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.555e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TUT1-205ENST00000476907 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-204ENST00000502643 583 ntTSL 411.48□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 311.25□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 WDR27-209ENST00000486490 492 ntTSL 511.24□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LITAF-219ENST00000576334 556 ntTSL 411.22□□□□□ -0.614e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ITGAE-201ENST00000263087 3858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.644e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-204ENST00000429001 4000 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.663e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-205ENST00000517559 559 ntTSL 410.65□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LITAF-206ENST00000571277 587 ntTSL 410.55□□□□□ -0.724e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-217ENST00000512274 372 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.755e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 MADD-215ENST00000460452 794 ntTSL 310.35□□□□□ -0.751e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LITAF-216ENST00000574848 554 ntTSL 410.34□□□□□ -0.754e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ALG3-213ENST00000485912 995 ntTSL 210.31□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SSBP1-210ENST00000481508 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.764e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 C1QTNF3-AMACR-201ENST00000382079 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.775e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 GPANK1-208ENST00000458083 802 ntTSL 310.08□□□□□ -0.84e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LITAF-207ENST00000571459 677 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.84e-13■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.815e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 49.94□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-207ENST00000503974 2081 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.845e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-223ENST00000627587 1853 ntTSL 29.64□□□□□ -0.875e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PPP1R13L-207ENST00000591986 648 ntTSL 39.53□□□□□ -0.885e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.925e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FXYD1-206ENST00000588715 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.975e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 EXOSC8-205ENST00000474661 738 ntTSL 58.85□□□□□ -0.993e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 RBMXL1-203ENST00000413769 991 ntTSL 28.8□□□□□ -15e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FGL1-205ENST00000427924 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-211ENST00000513701 555 ntTSL 48.62□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ITGAE-203ENST00000570415 1115 ntTSL 38.61□□□□□ -1.034e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.045e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-211ENST00000523389 588 ntTSL 38.44□□□□□ -1.063e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 38.4□□□□□ -1.069e-7■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-212ENST00000513832 821 ntTSL 48.37□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SSBP1-212ENST00000489378 1434 ntTSL 28.28□□□□□ -1.084e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-208ENST00000510598 563 ntTSL 1 (best)8.25□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SSBP1-208ENST00000469123 662 ntTSL 58.23□□□□□ -1.094e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.15e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.125e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PAPSS1-205ENST00000511304 927 ntTSL 38.06□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FGL1-202ENST00000381841 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.133e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.25e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SUPT6H-207ENST00000581908 679 ntTSL 37.53□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FGL1-208ENST00000519055 640 ntTSL 57.51□□□□□ -1.213e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FXYD1-209ENST00000590462 620 ntTSL 27.13□□□□□ -1.275e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LEMD2-210ENST00000512368 544 ntTSL 47□□□□□ -1.293e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 EXOSC8-210ENST00000490537 2423 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.333e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 IL1R1-206ENST00000413623 1678 ntTSL 36.74□□□□□ -1.337e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.44e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.453e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.453e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-216ENST00000550522 567 ntTSL 45.76□□□□□ -1.493e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 25.51□□□□□ -1.533e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SSBP1-204ENST00000465167 517 ntTSL 55.37□□□□□ -1.554e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 DENND3-206ENST00000518249 831 ntTSL 55.16□□□□□ -1.583e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 EXOSC8-201ENST00000239893 694 ntTSL 54.95□□□□□ -1.623e-6■□□□□ 11.1
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