Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-218ENST00000610292 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TOGARAM1-202ENST00000361577 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-227ENST00000622645 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-204ENST00000420246 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UNC93A-202ENST00000366829 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATG4B-207ENST00000415107 356 ntTSL 511.8□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FAM117A-204ENST00000503855 582 ntTSL 311.77□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM51-AS1-201ENST00000310916 7100 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ELF3-204ENST00000446188 769 ntTSL 511.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF20-205ENST00000480477 545 ntTSL 411.72□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KMT5A-203ENST00000437502 901 ntTSL 511.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 MOK-230ENST00000524019 649 ntTSL 411.68□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLCO4A1-AS1-203ENST00000451648 649 ntTSL 211.66□□□□□ -0.549e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TOGARAM1-201ENST00000361462 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-228ENST00000635293 1883 ntTSL 511.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NDUFA7-201ENST00000301457 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIAA1328-204ENST00000587139 3256 ntTSL 511.63□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-217ENST00000604348 568 ntTSL 411.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TSNAX-DISC1-204ENST00000602956 3294 ntAPPRIS P5 TSL 211.59□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AC074091.1-201ENST00000505973 1741 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-220ENST00000600583 782 ntTSL 411.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DNAJB1-210ENST00000601087 488 ntTSL 411.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TGFA-208ENST00000460808 470 ntTSL 411.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-216ENST00000599560 562 ntTSL 211.56□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 211.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF547-202ENST00000595335 596 ntTSL 311.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 NUP62-209ENST00000596437 894 ntTSL 411.46□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 EXOC5-207ENST00000555749 594 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC9A1-201ENST00000263980 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-222ENST00000617185 2724 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SHANK2-206ENST00000424924 6821 ntTSL 511.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 211.37□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PABPC1L-211ENST00000476056 1214 ntTSL 511.36□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABR-226ENST00000574257 532 ntTSL 411.35□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TGFA-203ENST00000418333 1225 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-202ENST00000339618 3828 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LINC01395-201ENST00000631195 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF274-205ENST00000594839 544 ntTSL 411.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMEM94-218ENST00000581252 522 ntTSL 511.26□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF559-ZNF177-209ENST00000603974 911 ntTSL 511.26□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PCMTD2-205ENST00000608844 528 ntTSL 411.21□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GRAMD2B-207ENST00000506445 994 ntTSL 511.21□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 WDPCP-201ENST00000272321 3392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 CSGALNACT1-202ENST00000397998 3962 ntTSL 211.18□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMCO1-204ENST00000465705 760 ntTSL 511.17□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SIL1-212ENST00000509400 547 ntTSL 411.17□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 LYRM1-210ENST00000568820 1695 ntTSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCAMP2-202ENST00000562363 638 ntTSL 511.15□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UGP2-226ENST00000496334 565 ntTSL 511.13□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 511.09□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC25A15-203ENST00000470509 511 ntTSL 511.07□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 FGFR1-231ENST00000527203 556 ntTSL 311.03□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 QRICH1-212ENST00000498392 2362 ntTSL 210.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AP002495.1-204ENST00000529844 1781 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SP140L-202ENST00000396563 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ABR-206ENST00000570441 690 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SLC39A11-205ENST00000579319 439 ntTSL 310.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 C1orf228-204ENST00000421398 564 ntTSL 310.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PIK3C2A-205ENST00000533645 2101 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.689e-14■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ORC6-209ENST00000575571 771 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 410.75□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 GATB-203ENST00000505211 697 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SCARB2-222ENST00000640634 1734 ntTSL 510.73□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ALDH3A2-206ENST00000472059 3710 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SNHG14-211ENST00000547292 626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 62.8
TBRG4Q969Z0 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 62.8
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 203.9 ms