Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SERF2-212ENST00000445816 2099 ntTSL 315.55■□□□□ 0.084e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.034e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.054e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 213.81□□□□□ -0.24e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-216ENST00000486144 1030 ntTSL 213.39□□□□□ -0.274e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.34e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.474e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-68■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.786e-8■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SCAMP4-204ENST00000414057 1477 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.586e-8■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-13■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-13■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 FLOT2-208ENST00000582174 703 ntTSL 322■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 520.9■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 FLOT2-207ENST00000581509 426 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 513.07□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 EIF4G1-215ENST00000427607 596 ntTSL 211.36□□□□□ -0.591e-7■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.193e-8■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 TIMM44-202ENST00000595565 868 ntTSL 315.3■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-8■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-8■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.161e-8■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-8■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 SATB2-207ENST00000463386 372 ntTSL 412.2□□□□□ -0.461e-8■■■■□ 24.6
PCBP1Q15365 ESPN-206ENST00000468561 664 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 515.66■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 TNS1-210ENST00000446903 2464 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.073e-7■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.794e-16■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.134e-16■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 PAH-208ENST00000549247 961 ntTSL 26.93□□□□□ -1.34e-16■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 PAH-211ENST00000551114 1109 ntTSL 26.02□□□□□ -1.454e-16■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 PAH-216ENST00000635477 429 ntTSL 54.5□□□□□ -1.694e-16■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.024e-9■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.224e-9■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.484e-9■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.664e-9■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.581e-14■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 PRKCSH-213ENST00000591510 591 ntTSL 317.71■□□□□ 0.431e-14■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 BAG6-249ENST00000441793 783 ntTSL 213.36□□□□□ -0.273e-7■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 BAG6-238ENST00000422948 513 ntTSL 27.59□□□□□ -1.193e-7■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 FKBP1A-207ENST00000474657 641 ntTSL 213.59□□□□□ -0.232e-20■■■■□ 24.5
PCBP1Q15365 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 24.4
PCBP1Q15365 TIMM44-203ENST00000595831 1797 ntTSL 516.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 24.4
PCBP1Q15365 TIMM44-204ENST00000595876 1206 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 24.4
PCBP1Q15365 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.191e-6■■■■□ 24.4
PCBP1Q15365 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.11e-7■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.651e-7■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 FCGRT-205ENST00000593431 582 ntTSL 321.57■■□□□ 1.042e-7■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SND1-203ENST00000463020 793 ntTSL 217.38■□□□□ 0.374e-9■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.098e-17■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.78e-17■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.798e-17■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.348e-7■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.9■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.257e-7■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.414e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.374e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.954e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.884e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.664e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 MYEOV-205ENST00000535653 2468 ntTSL 1 (best)17.65■□□□□ 0.424e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SDCCAG3-210ENST00000481114 340 ntTSL 214.95□□□□□ -0.024e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 MYEOV-211ENST00000544008 599 ntTSL 214.23□□□□□ -0.134e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SDCCAG3-205ENST00000417512 626 ntTSL 213.88□□□□□ -0.194e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SDCCAG3-207ENST00000461693 869 ntTSL 213.18□□□□□ -0.34e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 SDCCAG3-208ENST00000466579 496 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.724e-11■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 FKBP8-204ENST00000596015 612 ntTSL 318.84■□□□□ 0.615e-27■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 FKBP8-212ENST00000606531 460 ntTSL 216.28■□□□□ 0.25e-27■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 MKNK2-207ENST00000588014 2413 ntTSL 217.2■□□□□ 0.348e-8■■■■□ 24.3
PCBP1Q15365 TIAL1-210ENST00000479729 485 ntTSL 320.28■□□□□ 0.841e-11■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 TIMM44-205ENST00000597926 819 ntTSL 319.59■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 TIMM44-207ENST00000598675 744 ntTSL 315.36■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 519.98■□□□□ 0.799e-9■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.449e-9■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.449e-9■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 CNOT3-210ENST00000618939 4516 ntTSL 514.19□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 FADS2-213ENST00000523235 5073 ntTSL 214.22□□□□□ -0.134e-7■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.355e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 CX3CL1-202ENST00000563383 3313 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 FSCN3-204ENST00000478328 705 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.093e-7■■■■□ 24.2
PCBP1Q15365 CREBRF-206ENST00000523161 559 ntTSL 417.5■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAZAP2-211ENST00000551534 571 ntTSL 417.39■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAZAP2-207ENST00000549497 567 ntTSL 415.41■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC9.78□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 CREBRF-204ENST00000520464 5163 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.982e-7■■■■□ 24.1
PCBP1Q15365 DAZAP2-212ENST00000551919 485 ntTSL 48.88□□□□□ -0.992e-7■■■■□ 24.1
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