RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413554.5

TNS1-204, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 1,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-204ENST00000413554 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.76■■■■□ 3
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TNS1-204ENST00000413554 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.93■■■□□ 2.06
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TNS1-204ENST00000413554 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.13■■□□□ 1.77
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TNS1-204ENST00000413554 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.03■■□□□ 1.76
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TNS1-204ENST00000413554 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.84■■□□□ 1.73
TNS1-204ENST00000413554 SMARCA2P51531 1590 aa25.82■■□□□ 1.72
TNS1-204ENST00000413554 NCAPD3P42695 1498 aa25.82■■□□□ 1.72
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TNS1-204ENST00000413554 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25■■□□□ 1.59
TNS1-204ENST00000413554 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
TNS1-204ENST00000413554 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.75■■□□□ 1.55
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TNS1-204ENST00000413554 ERCC6Q03468 1493 aa24.73■■□□□ 1.55
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TNS1-204ENST00000413554 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.66■■□□□ 1.54
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TNS1-204ENST00000413554 ABCC8Q09428 1581 aa24.44■■□□□ 1.5
TNS1-204ENST00000413554 TOPBP1Q92547 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
TNS1-204ENST00000413554 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
TNS1-204ENST00000413554 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.39■■□□□ 1.49
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TNS1-204ENST00000413554 TOP2BQ02880 1626 aa24.27■■□□□ 1.48
TNS1-204ENST00000413554 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.24■■□□□ 1.47
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TNS1-204ENST00000413554 IFT140Q96RY7 1462 aa24.15■■□□□ 1.46
TNS1-204ENST00000413554 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.14■■□□□ 1.46
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TNS1-204ENST00000413554 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.03■■□□□ 1.44
TNS1-204ENST00000413554 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TNS1-204ENST00000413554 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
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TNS1-204ENST00000413554 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.88■■□□□ 1.41
TNS1-204ENST00000413554 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TNS1-204ENST00000413554 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.85■■□□□ 1.41
TNS1-204ENST00000413554 KIF27Q86VH2 1401 aa23.85■■□□□ 1.41
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TNS1-204ENST00000413554 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.79■■□□□ 1.4
TNS1-204ENST00000413554 IGF1RP08069 1367 aa23.77■■□□□ 1.4
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TNS1-204ENST00000413554 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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TNS1-204ENST00000413554 OSCARQ8IYS5 282 aa23.49■■□□□ 1.35
TNS1-204ENST00000413554 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.48■■□□□ 1.35
TNS1-204ENST00000413554 NUP160Q12769 1436 aa23.4■■□□□ 1.34
TNS1-204ENST00000413554 KIF21BO75037 1637 aa23.36■■□□□ 1.33
TNS1-204ENST00000413554 CEP170Q5SW79 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
TNS1-204ENST00000413554 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.29■■□□□ 1.32
TNS1-204ENST00000413554 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.28■■□□□ 1.32
TNS1-204ENST00000413554 GOLGA3Q08378 1498 aa23.28■■□□□ 1.32
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