RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620599.4

INO80E-214, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene INO80E, Length 515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-214ENST00000620599 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.92■■■■■ 5.58
INO80E-214ENST00000620599 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.64■■■■■ 4.74
INO80E-214ENST00000620599 ABCC9O60706 1549 aa44.07■■■■■ 4.65
INO80E-214ENST00000620599 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.2■■■■■ 4.35
INO80E-214ENST00000620599 NACADO15069 1562 aa42.03■■■■■ 4.32
INO80E-214ENST00000620599 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.89■■■■■ 4.3
INO80E-214ENST00000620599 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.6■■■■■ 4.25
INO80E-214ENST00000620599 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
INO80E-214ENST00000620599 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.35■■■■■ 4.21
INO80E-214ENST00000620599 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.27■■■■■ 4.2
INO80E-214ENST00000620599 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.08■■■■■ 4.17
INO80E-214ENST00000620599 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.95■■■■■ 4.15
INO80E-214ENST00000620599 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.82■■■■■ 4.13
INO80E-214ENST00000620599 SCRIBQ14160 1630 aa40.7■■■■■ 4.11
INO80E-214ENST00000620599 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.43■■■■■ 4.06
INO80E-214ENST00000620599 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
INO80E-214ENST00000620599 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.87■■■■□ 3.97
INO80E-214ENST00000620599 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.63■■■■□ 3.94
INO80E-214ENST00000620599 SMARCA4P51532 1647 aa38.87■■■■□ 3.81
INO80E-214ENST00000620599 NCAPD3P42695 1498 aa38.76■■■■□ 3.8
INO80E-214ENST00000620599 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
INO80E-214ENST00000620599 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.73■■■■□ 3.79
INO80E-214ENST00000620599 SMARCA2P51531 1590 aa38.68■■■■□ 3.78
INO80E-214ENST00000620599 HMGXB3Q12766 1538 aa38.56■■■■□ 3.76
INO80E-214ENST00000620599 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.48■■■■□ 3.75
INO80E-214ENST00000620599 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.47■■■■□ 3.75
INO80E-214ENST00000620599 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
INO80E-214ENST00000620599 WIZO95785 1651 aa38.09■■■■□ 3.69
INO80E-214ENST00000620599 ERCC6Q03468 1493 aa38.02■■■■□ 3.68
INO80E-214ENST00000620599 NESP48681 1621 aa38.01■■■■□ 3.67
INO80E-214ENST00000620599 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
INO80E-214ENST00000620599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.85■■■■□ 3.65
INO80E-214ENST00000620599 CUX2O14529 1486 aa37.76■■■■□ 3.63
INO80E-214ENST00000620599 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.62■■■■□ 3.61
INO80E-214ENST00000620599 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
INO80E-214ENST00000620599 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.6■■■■□ 3.61
INO80E-214ENST00000620599 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.57■■■■□ 3.6
INO80E-214ENST00000620599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
INO80E-214ENST00000620599 CFTRP13569 1480 aa37.3■■■■□ 3.56
INO80E-214ENST00000620599 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.24■■■■□ 3.55
INO80E-214ENST00000620599 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.2■■■■□ 3.55
INO80E-214ENST00000620599 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.2■■■■□ 3.54
INO80E-214ENST00000620599 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.16■■■■□ 3.54
INO80E-214ENST00000620599 WDR62O43379 1518 aa37.15■■■■□ 3.54
INO80E-214ENST00000620599 PRDM2Q13029 1718 aa37.11■■■■□ 3.53
INO80E-214ENST00000620599 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.1■■■■□ 3.53
INO80E-214ENST00000620599 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
INO80E-214ENST00000620599 TOPBP1Q92547 1522 aa36.56■■■■□ 3.44
INO80E-214ENST00000620599 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
INO80E-214ENST00000620599 ABCC8Q09428 1581 aa36.51■■■■□ 3.44
INO80E-214ENST00000620599 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.49■■■■□ 3.43
INO80E-214ENST00000620599 IFT140Q96RY7 1462 aa36.43■■■■□ 3.42
INO80E-214ENST00000620599 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
INO80E-214ENST00000620599 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
INO80E-214ENST00000620599 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
INO80E-214ENST00000620599 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
INO80E-214ENST00000620599 CUX1P39880 1505 aa36.13■■■■□ 3.38
INO80E-214ENST00000620599 OSCARQ8IYS5 282 aa36.09■■■■□ 3.37
INO80E-214ENST00000620599 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.07■■■■□ 3.37
INO80E-214ENST00000620599 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.07■■■■□ 3.37
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INO80E-214ENST00000620599 SOGA1O94964 1423 aa36.04■■■■□ 3.36
INO80E-214ENST00000620599 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
INO80E-214ENST00000620599 WDR97A6NE52 1622 aa35.89■■■■□ 3.34
INO80E-214ENST00000620599 CHD1O14646 1710 aa35.87■■■■□ 3.33
INO80E-214ENST00000620599 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.73■■■■□ 3.31
INO80E-214ENST00000620599 TRIM41Q8WV44 630 aa35.72■■■■□ 3.31
INO80E-214ENST00000620599 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.72■■■■□ 3.31
INO80E-214ENST00000620599 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.31
INO80E-214ENST00000620599 TOP2BQ02880 1626 aa35.71■■■■□ 3.31
INO80E-214ENST00000620599 FBLN2P98095 1184 aa35.7■■■■□ 3.31
INO80E-214ENST00000620599 SYNJ1O43426 1573 aa35.69■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.68■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 GRIN2BQ13224 1484 aa35.68■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 PBRM1Q86U86 1689 aa35.68■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.64■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.64■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.64■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.64■■■■□ 3.3
INO80E-214ENST00000620599 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.63■■■■□ 3.29
INO80E-214ENST00000620599 ARHGEF11O15085 1522 aa35.55■■■■□ 3.28
INO80E-214ENST00000620599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
INO80E-214ENST00000620599 SYNJ2O15056 1496 aa35.51■■■■□ 3.28
INO80E-214ENST00000620599 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.4■■■■□ 3.26
INO80E-214ENST00000620599 ADAMTS12P58397 1594 aa35.32■■■■□ 3.24
INO80E-214ENST00000620599 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.26■■■■□ 3.23
INO80E-214ENST00000620599 GRIN2AQ12879 1464 aa35.23■■■■□ 3.23
INO80E-214ENST00000620599 ARAP1Q96P48 1450 aa35.23■■■■□ 3.23
INO80E-214ENST00000620599 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.22■■■■□ 3.23
INO80E-214ENST00000620599 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.19■■■■□ 3.22
INO80E-214ENST00000620599 CEP170Q5SW79 1584 aa35.1■■■■□ 3.21
INO80E-214ENST00000620599 NUP160Q12769 1436 aa35.08■■■■□ 3.21
INO80E-214ENST00000620599 KIF27Q86VH2 1401 aa35■■■■□ 3.19
INO80E-214ENST00000620599 SHROOM2Q13796 1616 aa34.92■■■■□ 3.18
INO80E-214ENST00000620599 IGF1RP08069 1367 aa34.89■■■■□ 3.18
INO80E-214ENST00000620599 CUL7Q14999 1698 aa34.89■■■■□ 3.18
INO80E-214ENST00000620599 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.89■■■■□ 3.18
INO80E-214ENST00000620599 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.81■■■■□ 3.16
INO80E-214ENST00000620599 JPH4Q96JJ6 628 aa34.7■■■■□ 3.15
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