Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.229e-22■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.197e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.17e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.524e-8■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.454e-8■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.349e-22■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 MTM1-204ENST00000424519 361 ntTSL 316.65■□□□□ 0.267e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.167e-14■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.014e-12■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-12■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 ANKRD52-203ENST00000548241 651 ntTSL 314.39□□□□□ -0.117e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CHD4-203ENST00000535717 660 ntTSL 213.3□□□□□ -0.284e-12■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.344e-12■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 MTM1-205ENST00000490530 806 ntTSL 310.6□□□□□ -0.717e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 SLC7A6-205ENST00000563080 1030 ntTSL 510.47□□□□□ -0.737e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.97e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.967e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 SLC7A6-210ENST00000566579 526 ntTSL 47.56□□□□□ -1.27e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 SLC7A6-213ENST00000567346 543 ntTSL 27.46□□□□□ -1.227e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.227e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.237e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.337e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.367e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 MTM1-201ENST00000306167 2955 ntTSL 55.93□□□□□ -1.467e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.517e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.567e-9■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 ARHGEF40-202ENST00000553709 5204 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.084e-6■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 ARHGEF40-207ENST00000556399 4902 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -04e-6■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 ARHGEF40-206ENST00000555232 3902 ntTSL 212.35□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 DCAF7-202ENST00000431926 1354 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.23e-7■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 DCAF7-203ENST00000580091 325 ntTSL 310.89□□□□□ -0.673e-7■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-7■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.887e-7■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-8■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 511.44□□□□□ -0.583e-8■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 NDUFA10-210ENST00000471378 582 ntTSL 310.85□□□□□ -0.673e-8■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 318.02■□□□□ 0.481e-10■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-8■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-8■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 310.8□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 KDELR1-202ENST00000594643 561 ntTSL 222.31■■□□□ 1.165e-10■■■■□ 25.2
PCBP1Q15365 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 316.61■□□□□ 0.257e-7■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.195e-7■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 RAB35-206ENST00000544304 2449 ntTSL 221.9■■□□□ 1.14e-6■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.154e-6■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 PROSER1-205ENST00000484434 2150 ntTSL 29.34□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 RNF44-203ENST00000504434 785 ntTSL 222.67■■□□□ 1.226e-8■■■■□ 25.1
PCBP1Q15365 MAEA-210ENST00000508634 694 ntTSL 218.63■□□□□ 0.574e-8■■■■□ 25
PCBP1Q15365 PDLIM7-206ENST00000463411 1015 ntTSL 224.69■■□□□ 1.542e-12■■■■□ 25
PCBP1Q15365 DENND4B-212ENST00000494683 456 ntTSL 315.34■□□□□ 0.053e-10■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-SAPCD1-208ENST00000498473 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.228e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.068e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.038e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.088e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 514.35□□□□□ -0.118e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.338e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 510.73□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.988e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.673e-9■■■■□ 25
PCBP1Q15365 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.443e-9■■■■□ 25
PCBP1Q15365 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.33e-9■■■■□ 25
PCBP1Q15365 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 25
PCBP1Q15365 ADD2-203ENST00000403045 3745 ntTSL 29.73□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 25
PCBP1Q15365 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 25
PCBP1Q15365 GPX2-202ENST00000553522 1134 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.53e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 GPX2-205ENST00000612794 1084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.033e-7■■■■□ 25
PCBP1Q15365 SEMA4G-212ENST00000613292 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-8■■■■□ 24.9
PCBP1Q15365 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 24.9
PCBP1Q15365 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.844e-6■■■■□ 24.9
PCBP1Q15365 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 24.9
PCBP1Q15365 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.389e-7■■■■□ 24.9
PCBP1Q15365 GDI1-207ENST00000468483 2417 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 24.9
PCBP1Q15365 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.181e-7■■■■□ 24.8
PCBP1Q15365 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-7■■■■□ 24.8
PCBP1Q15365 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.711e-7■■■■□ 24.8
PCBP1Q15365 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 24.8
PCBP1Q15365 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 24.8
PCBP1Q15365 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 24.8
PCBP1Q15365 PRSS21-203ENST00000570594 809 ntTSL 320.48■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 24.8
PCBP1Q15365 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.385e-7■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.14e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.54e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.274e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.244e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-211ENST00000430901 483 ntTSL 416.52■□□□□ 0.244e-21■■■■□ 24.7
PCBP1Q15365 SERF2-208ENST00000409617 700 ntTSL 216.36■□□□□ 0.214e-21■■■■□ 24.7
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