RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.69■■□□□ 1.06
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PTPRS-201ENST00000262963 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRS-201ENST00000262963 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRS-201ENST00000262963 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
PTPRS-201ENST00000262963 APLP2Q06481 763 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRS-201ENST00000262963 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.93■□□□□ 0.62
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM41Q8WV44 630 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRS-201ENST00000262963 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRS-201ENST00000262963 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRS-201ENST00000262963 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRS-201ENST00000262963 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.44■□□□□ 0.54
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PTPRS-201ENST00000262963 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
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PTPRS-201ENST00000262963 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
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PTPRS-201ENST00000262963 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.479e-7■■□□□ 12.3
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PTPRS-201ENST00000262963 NEFLP07196 543 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRS-201ENST00000262963 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRS-201ENST00000262963 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
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PTPRS-201ENST00000262963 ITGAEP38570 1179 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRS-201ENST00000262963 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRS-201ENST00000262963 SCRIBQ14160 1630 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRS-201ENST00000262963 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRS-201ENST00000262963 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.5■□□□□ 0.39
PTPRS-201ENST00000262963 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.47■□□□□ 0.39
PTPRS-201ENST00000262963 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.41■□□□□ 0.38
PTPRS-201ENST00000262963 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRS-201ENST00000262963 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
PTPRS-201ENST00000262963 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRS-201ENST00000262963 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
PTPRS-201ENST00000262963 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
PTPRS-201ENST00000262963 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
PTPRS-201ENST00000262963 P3H3Q8IVL6 736 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM52Q96A61 297 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRS-201ENST00000262963 NEUROD1Q13562 356 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRS-201ENST00000262963 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRS-201ENST00000262963 NACADO15069 1562 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRS-201ENST00000262963 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PTPRS-201ENST00000262963 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.1■□□□□ 0.33
PTPRS-201ENST00000262963 FBLN2P98095 1184 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRS-201ENST00000262963 ARID3CA6NKF2 412 aa17■□□□□ 0.31
PTPRS-201ENST00000262963 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRS-201ENST00000262963 ANP32CO43423 234 aa16.97■□□□□ 0.31
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PTPRS-201ENST00000262963 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
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PTPRS-201ENST00000262963 CEP162Q5TB80 1403 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRS-201ENST00000262963 EEA1Q15075 1411 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA3Q08378 1498 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRS-201ENST00000262963 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-201ENST00000262963 BCANQ96GW7 911 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-201ENST00000262963 SOGA1O94964 1423 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRS-201ENST00000262963 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRS-201ENST00000262963 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRS-201ENST00000262963 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRS-201ENST00000262963 NEFMP07197 916 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRS-201ENST00000262963 TONSLQ96HA7 1378 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRS-201ENST00000262963 KIF27Q86VH2 1401 aa16.66■□□□□ 0.26
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PTPRS-201ENST00000262963 WIZO95785 1651 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRS-201ENST00000262963 MIER1Q8N108 512 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRS-201ENST00000262963 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRS-201ENST00000262963 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRS-201ENST00000262963 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
PTPRS-201ENST00000262963 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRS-201ENST00000262963 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRS-201ENST00000262963 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 SLC24A1O60721 1099 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 TSPY4P0CV99 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 TSPY10P0CW01 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 CUX2O14529 1486 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRS-201ENST00000262963 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRS-201ENST00000262963 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.44■□□□□ 0.22
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