RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.69■■□□□ 1.06
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PTPRS-201ENST00000262963 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRS-201ENST00000262963 TRIM41Q8WV44 630 aa18.82■□□□□ 0.6
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PTPRS-201ENST00000262963 NEFLP07196 543 aa17.86■□□□□ 0.45
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PTPRS-201ENST00000262963 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
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PTPRS-201ENST00000262963 TRIM52Q96A61 297 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRS-201ENST00000262963 NEUROD1Q13562 356 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRS-201ENST00000262963 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.16■□□□□ 0.34
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PTPRS-201ENST00000262963 CEP162Q5TB80 1403 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRS-201ENST00000262963 EEA1Q15075 1411 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
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PTPRS-201ENST00000262963 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA3Q08378 1498 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRS-201ENST00000262963 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRS-201ENST00000262963 BCANQ96GW7 911 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-201ENST00000262963 SOGA1O94964 1423 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRS-201ENST00000262963 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTPRS-201ENST00000262963 TONSLQ96HA7 1378 aa16.66■□□□□ 0.26
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PTPRS-201ENST00000262963 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRS-201ENST00000262963 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 SLC24A1O60721 1099 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 TSPY4P0CV99 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 TSPY10P0CW01 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRS-201ENST00000262963 CUX2O14529 1486 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRS-201ENST00000262963 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRS-201ENST00000262963 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.44■□□□□ 0.22
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