RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424519.1

MTM1-204, Transcript of myotubularin 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTM1, Length 361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1-204ENST00000424519 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.43■■■■□ 3.58
MTM1-204ENST00000424519 ABCC9O60706 1549 aa33.49■■■□□ 2.95
MTM1-204ENST00000424519 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.42■■■□□ 2.94
MTM1-204ENST00000424519 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.8■■■□□ 2.68
MTM1-204ENST00000424519 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.77■■■□□ 2.68
MTM1-204ENST00000424519 NACADO15069 1562 aa31.6■■■□□ 2.65
MTM1-204ENST00000424519 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.44■■■□□ 2.62
MTM1-204ENST00000424519 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
MTM1-204ENST00000424519 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.19■■■□□ 2.58
MTM1-204ENST00000424519 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.14■■■□□ 2.58
MTM1-204ENST00000424519 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
MTM1-204ENST00000424519 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.96■■■□□ 2.55
MTM1-204ENST00000424519 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.83■■■□□ 2.53
MTM1-204ENST00000424519 SCRIBQ14160 1630 aa30.61■■■□□ 2.49
MTM1-204ENST00000424519 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.31■■■□□ 2.44
MTM1-204ENST00000424519 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.21■■■□□ 2.43
MTM1-204ENST00000424519 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
MTM1-204ENST00000424519 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.1■■■□□ 2.41
MTM1-204ENST00000424519 NCAPD3P42695 1498 aa29.22■■■□□ 2.27
MTM1-204ENST00000424519 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.19■■■□□ 2.26
MTM1-204ENST00000424519 SMARCA4P51532 1647 aa29.16■■■□□ 2.26
MTM1-204ENST00000424519 SMARCA2P51531 1590 aa29.02■■■□□ 2.24
MTM1-204ENST00000424519 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
MTM1-204ENST00000424519 HMGXB3Q12766 1538 aa28.94■■■□□ 2.22
MTM1-204ENST00000424519 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.91■■■□□ 2.22
MTM1-204ENST00000424519 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
MTM1-204ENST00000424519 NESP48681 1621 aa28.83■■■□□ 2.21
MTM1-204ENST00000424519 ERCC6Q03468 1493 aa28.83■■■□□ 2.21
MTM1-204ENST00000424519 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.81■■■□□ 2.2
MTM1-204ENST00000424519 CUX2O14529 1486 aa28.66■■■□□ 2.18
MTM1-204ENST00000424519 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.65■■■□□ 2.18
MTM1-204ENST00000424519 WIZO95785 1651 aa28.58■■■□□ 2.17
MTM1-204ENST00000424519 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.5■■■□□ 2.15
MTM1-204ENST00000424519 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.41■■■□□ 2.14
MTM1-204ENST00000424519 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
MTM1-204ENST00000424519 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.37■■■□□ 2.13
MTM1-204ENST00000424519 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.35■■■□□ 2.13
MTM1-204ENST00000424519 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
MTM1-204ENST00000424519 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
MTM1-204ENST00000424519 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.11■■■□□ 2.09
MTM1-204ENST00000424519 CFTRP13569 1480 aa28.04■■■□□ 2.08
MTM1-204ENST00000424519 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.04■■■□□ 2.08
MTM1-204ENST00000424519 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.02■■■□□ 2.08
MTM1-204ENST00000424519 WDR62O43379 1518 aa28.01■■■□□ 2.07
MTM1-204ENST00000424519 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.9■■■□□ 2.06
MTM1-204ENST00000424519 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
MTM1-204ENST00000424519 PRDM2Q13029 1718 aa27.73■■■□□ 2.03
MTM1-204ENST00000424519 TOPBP1Q92547 1522 aa27.53■■■□□ 2
MTM1-204ENST00000424519 TRIM41Q8WV44 630 aa27.53■■■□□ 2
MTM1-204ENST00000424519 OSCARQ8IYS5 282 aa27.51■■□□□ 1.99
MTM1-204ENST00000424519 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MTM1-204ENST00000424519 IFT140Q96RY7 1462 aa27.45■■□□□ 1.99
MTM1-204ENST00000424519 ABCC8Q09428 1581 aa27.39■■□□□ 1.98
MTM1-204ENST00000424519 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.39■■□□□ 1.98
MTM1-204ENST00000424519 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
MTM1-204ENST00000424519 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
MTM1-204ENST00000424519 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
MTM1-204ENST00000424519 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
MTM1-204ENST00000424519 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
MTM1-204ENST00000424519 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.24■■□□□ 1.95
MTM1-204ENST00000424519 SOGA1O94964 1423 aa27.18■■□□□ 1.94
MTM1-204ENST00000424519 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
MTM1-204ENST00000424519 CUX1P39880 1505 aa27.13■■□□□ 1.93
MTM1-204ENST00000424519 FBLN2P98095 1184 aa27.13■■□□□ 1.93
MTM1-204ENST00000424519 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.12■■□□□ 1.93
MTM1-204ENST00000424519 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.1■■□□□ 1.93
MTM1-204ENST00000424519 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.1■■□□□ 1.93
MTM1-204ENST00000424519 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.1■■□□□ 1.93
MTM1-204ENST00000424519 CHD1O14646 1710 aa27.09■■□□□ 1.93
MTM1-204ENST00000424519 ARHGEF11O15085 1522 aa27■■□□□ 1.91
MTM1-204ENST00000424519 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.94■■□□□ 1.9
MTM1-204ENST00000424519 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.93■■□□□ 1.9
MTM1-204ENST00000424519 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
MTM1-204ENST00000424519 WDR97A6NE52 1622 aa26.86■■□□□ 1.89
MTM1-204ENST00000424519 GRIN2BQ13224 1484 aa26.86■■□□□ 1.89
MTM1-204ENST00000424519 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.81■■□□□ 1.88
MTM1-204ENST00000424519 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
MTM1-204ENST00000424519 PBRM1Q86U86 1689 aa26.77■■□□□ 1.88
MTM1-204ENST00000424519 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.77■■□□□ 1.88
MTM1-204ENST00000424519 ARAP1Q96P48 1450 aa26.77■■□□□ 1.88
MTM1-204ENST00000424519 SYNJ2O15056 1496 aa26.74■■□□□ 1.87
MTM1-204ENST00000424519 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.73■■□□□ 1.87
MTM1-204ENST00000424519 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.71■■□□□ 1.87
MTM1-204ENST00000424519 SYNJ1O43426 1573 aa26.71■■□□□ 1.87
MTM1-204ENST00000424519 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
MTM1-204ENST00000424519 TOP2BQ02880 1626 aa26.67■■□□□ 1.86
MTM1-204ENST00000424519 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.67■■□□□ 1.86
MTM1-204ENST00000424519 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
MTM1-204ENST00000424519 GRIN2AQ12879 1464 aa26.52■■□□□ 1.84
MTM1-204ENST00000424519 ADAMTS12P58397 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
MTM1-204ENST00000424519 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.45■■□□□ 1.82
MTM1-204ENST00000424519 CEP170Q5SW79 1584 aa26.45■■□□□ 1.82
MTM1-204ENST00000424519 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.44■■□□□ 1.82
MTM1-204ENST00000424519 NUP160Q12769 1436 aa26.41■■□□□ 1.82
MTM1-204ENST00000424519 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.41■■□□□ 1.82
MTM1-204ENST00000424519 SHROOM2Q13796 1616 aa26.27■■□□□ 1.8
MTM1-204ENST00000424519 JPH4Q96JJ6 628 aa26.26■■□□□ 1.79
MTM1-204ENST00000424519 IGF1RP08069 1367 aa26.23■■□□□ 1.79
MTM1-204ENST00000424519 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
MTM1-204ENST00000424519 KIF27Q86VH2 1401 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms