Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 PARP6-201ENST00000260376 2142 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-205ENST00000544520 2341 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-205ENST00000546859 595 ntTSL 29.51□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DDX59-204ENST00000433235 889 ntTSL 39.18□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CCT2-208ENST00000550010 1754 ntTSL 59.09□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DDX59-203ENST00000429498 725 ntTSL 38.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DIAPH1-212ENST00000518484 546 ntTSL 47.84□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 ATP11C-209ENST00000485626 643 ntTSL 56.06□□□□□ -1.445e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 PARP6-208ENST00000565999 740 ntTSL 56.02□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.665e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 DDX59-208ENST00000453944 643 ntTSL 34.53□□□□□ -1.685e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NEDD4-209ENST00000508871 5707 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.735e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.97□□□□□ -1.775e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NEDD4-204ENST00000503468 6339 ntTSL 1 (best)3.16□□□□□ -1.95e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.925e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -25e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 NSD3-212ENST00000534539 301 ntTSL 42.4□□□□□ -2.035e-7■■■■■ 27.5
AARSP49588 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 27.4
AARSP49588 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 317.58■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 27.3
AARSP49588 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.284e-6■■■■■ 27.3
AARSP49588 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.224e-6■■■■■ 27.3
AARSP49588 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 321.5■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 27.3
AARSP49588 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 416.23■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 27.3
AARSP49588 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 27.2
AARSP49588 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 416.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 27.1
AARSP49588 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 415.46■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 27.1
AARSP49588 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 27.1
AARSP49588 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 27.1
AARSP49588 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 27.1
AARSP49588 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 311.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 27.1
AARSP49588 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 417.41■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 26.9
AARSP49588 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 216.5■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 26.9
AARSP49588 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 516.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 26.9
AARSP49588 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 26.9
AARSP49588 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 26.9
AARSP49588 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 26.9
AARSP49588 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 26.9
AARSP49588 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 323.36■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.198e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 519.29■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 317.96■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 416.98■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 26.8
AARSP49588 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 26.7
AARSP49588 CEP85-203ENST00000453146 2821 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 26.7
AARSP49588 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 210.16□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 26.7
AARSP49588 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 26.7
AARSP49588 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 26.7
AARSP49588 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 26.5
AARSP49588 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.851e-6■■■■□ 26.4
AARSP49588 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 26.3
AARSP49588 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 26.3
AARSP49588 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 26.3
AARSP49588 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.621e-11■■■■□ 26.2
AARSP49588 WDR34-204ENST00000473486 714 ntTSL 227.43■■□□□ 1.982e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 MMP17-210ENST00000545671 775 ntTSL 326.76■■□□□ 1.872e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.722e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.662e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 MMP17-211ENST00000545790 552 ntTSL 225.27■■□□□ 1.642e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 WDR34-205ENST00000480613 739 ntTSL 325.24■■□□□ 1.632e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 324.87■■□□□ 1.572e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-220ENST00000598108 1118 ntTSL 324.71■■□□□ 1.552e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-212ENST00000567536 484 ntTSL 324.3■■□□□ 1.482e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.442e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.42e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.392e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 WDR34-203ENST00000451652 1039 ntTSL 223.11■■□□□ 1.292e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 PKD1-205ENST00000469241 659 ntTSL 222.43■■□□□ 1.182e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.162e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 522.26■■□□□ 1.152e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 PKD1-237ENST00000569983 722 ntTSL 521.9■■□□□ 1.12e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.052e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.972e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.932e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 520.45■□□□□ 0.862e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 PKD1-235ENST00000568591 2545 ntTSL 220.41■□□□□ 0.862e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-209ENST00000595034 739 ntTSL 320.03■□□□□ 0.82e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-205ENST00000593337 633 ntTSL 319.85■□□□□ 0.772e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-216ENST00000597180 301 ntTSL 519.61■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.682e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-230ENST00000601809 768 ntTSL 219.04■□□□□ 0.642e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 PKD1-214ENST00000483024 465 ntTSL 518.91■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 PKD1-204ENST00000468674 490 ntTSL 518.77■□□□□ 0.62e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 IRF3-208ENST00000594387 800 ntTSL 318.75■□□□□ 0.592e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-7■■■■□ 26.2
AARSP49588 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■■■□ 26.2
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 112.6 ms