RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563291.1

ANKRD11-208, Transcript of ankyrin repeat domain 11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD11, Length 593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD11-208ENST00000563291 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.32■■■■□ 3.24
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ANKRD11-208ENST00000563291 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.97■■■□□ 2.39
ANKRD11-208ENST00000563291 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD11-208ENST00000563291 NACADO15069 1562 aa29.79■■■□□ 2.36
ANKRD11-208ENST00000563291 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.41■■■□□ 2.3
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ANKRD11-208ENST00000563291 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.31■■■□□ 2.28
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ANKRD11-208ENST00000563291 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.09■■■□□ 2.25
ANKRD11-208ENST00000563291 SCRIBQ14160 1630 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD11-208ENST00000563291 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD11-208ENST00000563291 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.38■■■□□ 2.13
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ANKRD11-208ENST00000563291 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.29■■■□□ 2.12
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ANKRD11-208ENST00000563291 SMARCA2P51531 1590 aa27.4■■□□□ 1.98
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ANKRD11-208ENST00000563291 ERCC6Q03468 1493 aa27.15■■□□□ 1.94
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ANKRD11-208ENST00000563291 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD11-208ENST00000563291 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.43■■□□□ 1.82
ANKRD11-208ENST00000563291 WDR62O43379 1518 aa26.39■■□□□ 1.82
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ANKRD11-208ENST00000563291 PRDM2Q13029 1718 aa26.12■■□□□ 1.77
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ANKRD11-208ENST00000563291 IFT140Q96RY7 1462 aa25.89■■□□□ 1.73
ANKRD11-208ENST00000563291 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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ANKRD11-208ENST00000563291 SOGA1O94964 1423 aa25.59■■□□□ 1.69
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ANKRD11-208ENST00000563291 FBLN2P98095 1184 aa25.49■■□□□ 1.67
ANKRD11-208ENST00000563291 CHD1O14646 1710 aa25.45■■□□□ 1.66
ANKRD11-208ENST00000563291 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD11-208ENST00000563291 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD11-208ENST00000563291 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
ANKRD11-208ENST00000563291 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.4■■□□□ 1.66
ANKRD11-208ENST00000563291 ARHGEF11O15085 1522 aa25.38■■□□□ 1.65
ANKRD11-208ENST00000563291 WDR97A6NE52 1622 aa25.37■■□□□ 1.65
ANKRD11-208ENST00000563291 GRIN2BQ13224 1484 aa25.34■■□□□ 1.65
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ANKRD11-208ENST00000563291 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ANKRD11-208ENST00000563291 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.28■■□□□ 1.64
ANKRD11-208ENST00000563291 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD11-208ENST00000563291 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
ANKRD11-208ENST00000563291 SYNJ2O15056 1496 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD11-208ENST00000563291 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD11-208ENST00000563291 PBRM1Q86U86 1689 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD11-208ENST00000563291 SYNJ1O43426 1573 aa25.22■■□□□ 1.63
ANKRD11-208ENST00000563291 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.21■■□□□ 1.63
ANKRD11-208ENST00000563291 TOP2BQ02880 1626 aa25.2■■□□□ 1.62
ANKRD11-208ENST00000563291 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.19■■□□□ 1.62
ANKRD11-208ENST00000563291 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
ANKRD11-208ENST00000563291 ARAP1Q96P48 1450 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD11-208ENST00000563291 ADAMTS12P58397 1594 aa25.03■■□□□ 1.6
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ANKRD11-208ENST00000563291 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD11-208ENST00000563291 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD11-208ENST00000563291 CEP170Q5SW79 1584 aa24.92■■□□□ 1.58
ANKRD11-208ENST00000563291 NUP160Q12769 1436 aa24.91■■□□□ 1.58
ANKRD11-208ENST00000563291 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
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ANKRD11-208ENST00000563291 KIF27Q86VH2 1401 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD11-208ENST00000563291 SHROOM2Q13796 1616 aa24.74■■□□□ 1.55
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ANKRD11-208ENST00000563291 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ANKRD11-208ENST00000563291 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.67■■□□□ 1.54
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