RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545671.5

MMP17-210, Transcript of matrix metallopeptidase 17, humanhuman

TSL 3

Gene MMP17, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17-210ENST00000545671 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.99■■■■■ 7.19
MMP17-210ENST00000545671 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.39■■■■■ 6.14
MMP17-210ENST00000545671 ABCC9O60706 1549 aa51.87■■■■■ 5.89
MMP17-210ENST00000545671 NACADO15069 1562 aa50.14■■■■■ 5.62
MMP17-210ENST00000545671 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.13■■■■■ 5.61
MMP17-210ENST00000545671 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
MMP17-210ENST00000545671 MYO15BQ96JP2 1530 aa50■■■■■ 5.59
MMP17-210ENST00000545671 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.79■■■■■ 5.56
MMP17-210ENST00000545671 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.74■■■■■ 5.55
MMP17-210ENST00000545671 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.95■■■■■ 5.43
MMP17-210ENST00000545671 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.56■■■■■ 5.36
MMP17-210ENST00000545671 SCRIBQ14160 1630 aa48.52■■■■■ 5.36
MMP17-210ENST00000545671 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.4■■■■■ 5.34
MMP17-210ENST00000545671 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
MMP17-210ENST00000545671 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.25■■■■■ 5.31
MMP17-210ENST00000545671 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
MMP17-210ENST00000545671 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.02■■■■■ 5.12
MMP17-210ENST00000545671 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.67■■■■■ 5.06
MMP17-210ENST00000545671 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
MMP17-210ENST00000545671 SMARCA4P51532 1647 aa46.52■■■■■ 5.04
MMP17-210ENST00000545671 SMARCA2P51531 1590 aa46.24■■■■■ 4.99
MMP17-210ENST00000545671 NCAPD3P42695 1498 aa46.24■■■■■ 4.99
MMP17-210ENST00000545671 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.23■■■■■ 4.99
MMP17-210ENST00000545671 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.18■■■■■ 4.98
MMP17-210ENST00000545671 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.16■■■■■ 4.98
MMP17-210ENST00000545671 HMGXB3Q12766 1538 aa46.06■■■■■ 4.96
MMP17-210ENST00000545671 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
MMP17-210ENST00000545671 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.91
MMP17-210ENST00000545671 WIZO95785 1651 aa45.65■■■■■ 4.9
MMP17-210ENST00000545671 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
MMP17-210ENST00000545671 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.01■■■■■ 4.8
MMP17-210ENST00000545671 NESP48681 1621 aa44.92■■■■■ 4.78
MMP17-210ENST00000545671 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.84■■■■■ 4.77
MMP17-210ENST00000545671 ERCC6Q03468 1493 aa44.75■■■■■ 4.75
MMP17-210ENST00000545671 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.67■■■■■ 4.74
MMP17-210ENST00000545671 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.66■■■■■ 4.74
MMP17-210ENST00000545671 CFTRP13569 1480 aa44.64■■■■■ 4.74
MMP17-210ENST00000545671 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.47■■■■■ 4.71
MMP17-210ENST00000545671 CUX2O14529 1486 aa44.4■■■■■ 4.7
MMP17-210ENST00000545671 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
MMP17-210ENST00000545671 PRDM2Q13029 1718 aa44.37■■■■■ 4.69
MMP17-210ENST00000545671 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
MMP17-210ENST00000545671 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.31■■■■■ 4.68
MMP17-210ENST00000545671 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.26■■■■■ 4.68
MMP17-210ENST00000545671 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.19■■■■■ 4.66
MMP17-210ENST00000545671 WDR62O43379 1518 aa44.08■■■■■ 4.65
MMP17-210ENST00000545671 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.05■■■■■ 4.64
MMP17-210ENST00000545671 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
MMP17-210ENST00000545671 ABCC8Q09428 1581 aa43.72■■■■■ 4.59
MMP17-210ENST00000545671 TOPBP1Q92547 1522 aa43.63■■■■■ 4.57
MMP17-210ENST00000545671 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.63■■■■■ 4.57
MMP17-210ENST00000545671 IFT140Q96RY7 1462 aa43.36■■■■■ 4.53
MMP17-210ENST00000545671 CUX1P39880 1505 aa43.32■■■■■ 4.52
MMP17-210ENST00000545671 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
MMP17-210ENST00000545671 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
MMP17-210ENST00000545671 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.14■■■■■ 4.5
MMP17-210ENST00000545671 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.499e-6■■■■■ 50.1
MMP17-210ENST00000545671 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.04■■■■■ 4.48
MMP17-210ENST00000545671 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
MMP17-210ENST00000545671 SOGA1O94964 1423 aa43.04■■■■■ 4.48
MMP17-210ENST00000545671 TOP2BQ02880 1626 aa43.04■■■■■ 4.48
MMP17-210ENST00000545671 WDR97A6NE52 1622 aa42.99■■■■■ 4.47
MMP17-210ENST00000545671 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.98■■■■■ 4.47
MMP17-210ENST00000545671 SYNJ1O43426 1573 aa42.95■■■■■ 4.47
MMP17-210ENST00000545671 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
MMP17-210ENST00000545671 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.81■■■■■ 4.44
MMP17-210ENST00000545671 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.79■■■■■ 4.442e-6■■■□□ 15.8
MMP17-210ENST00000545671 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
MMP17-210ENST00000545671 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.63■■■■■ 4.41
MMP17-210ENST00000545671 GRIN2BQ13224 1484 aa42.59■■■■■ 4.41
MMP17-210ENST00000545671 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.58■■■■■ 4.41
MMP17-210ENST00000545671 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
MMP17-210ENST00000545671 PBRM1Q86U86 1689 aa42.51■■■■■ 4.39
MMP17-210ENST00000545671 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.46■■■■■ 4.39
MMP17-210ENST00000545671 OSCARQ8IYS5 282 aa42.43■■■■■ 4.38
MMP17-210ENST00000545671 CHD1O14646 1710 aa42.37■■■■■ 4.37
MMP17-210ENST00000545671 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.32■■■■■ 4.37
MMP17-210ENST00000545671 SYNJ2O15056 1496 aa42.31■■■■■ 4.36
MMP17-210ENST00000545671 TRIM41Q8WV44 630 aa42.27■■■■■ 4.36
MMP17-210ENST00000545671 KIF27Q86VH2 1401 aa42.2■■■■■ 4.35
MMP17-210ENST00000545671 ADAMTS12P58397 1594 aa42.2■■■■■ 4.35
MMP17-210ENST00000545671 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
MMP17-210ENST00000545671 FBLN2P98095 1184 aa42.15■■■■■ 4.34
MMP17-210ENST00000545671 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.12■■■■■ 4.33
MMP17-210ENST00000545671 GRIN2AQ12879 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
MMP17-210ENST00000545671 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.99■■■■■ 4.31
MMP17-210ENST00000545671 IGF1RP08069 1367 aa41.98■■■■■ 4.31
MMP17-210ENST00000545671 CUL7Q14999 1698 aa41.97■■■■■ 4.31
MMP17-210ENST00000545671 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
MMP17-210ENST00000545671 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
MMP17-210ENST00000545671 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.91■■■■■ 4.3
MMP17-210ENST00000545671 NUP160Q12769 1436 aa41.88■■■■■ 4.3
MMP17-210ENST00000545671 CEP170Q5SW79 1584 aa41.8■■■■■ 4.28
MMP17-210ENST00000545671 ARHGEF11O15085 1522 aa41.79■■■■■ 4.28
MMP17-210ENST00000545671 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.73■■■■■ 4.27
MMP17-210ENST00000545671 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.71■■■■■ 4.27
MMP17-210ENST00000545671 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.6■■■■■ 4.25
MMP17-210ENST00000545671 SHROOM2Q13796 1616 aa41.58■■■■■ 4.25
MMP17-210ENST00000545671 EEA1Q15075 1411 aa41.55■■■■■ 4.24
MMP17-210ENST00000545671 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.53■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms