Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y536

PPIAL4A, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4A, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIAL4AQ9Y536 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPIAL4AQ9Y536 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPIAL4AQ9Y536 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPIAL4AQ9Y536 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPIAL4AQ9Y536 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPIAL4AQ9Y536 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPIAL4AQ9Y536 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPIAL4AQ9Y536 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4AQ9Y536 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms