Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PEF1Q9UBV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEF1Q9UBV8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEF1Q9UBV8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEF1Q9UBV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PEF1Q9UBV8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEF1Q9UBV8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEF1Q9UBV8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms