Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXC2

GFOD1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFOD1Q9NXC2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFOD1Q9NXC2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GFOD1Q9NXC2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFOD1Q9NXC2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFOD1Q9NXC2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFOD1Q9NXC2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFOD1Q9NXC2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFOD1Q9NXC2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFOD1Q9NXC2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFOD1Q9NXC2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFOD1Q9NXC2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFOD1Q9NXC2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GFOD1Q9NXC2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFOD1Q9NXC2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFOD1Q9NXC2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFOD1Q9NXC2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFOD1Q9NXC2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFOD1Q9NXC2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFOD1Q9NXC2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms