Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PREBQ9HCU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PREBQ9HCU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PREBQ9HCU5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PREBQ9HCU5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PREBQ9HCU5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREBQ9HCU5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PREBQ9HCU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PREBQ9HCU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms