Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPSL2Q6UWE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLPSL2Q6UWE3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLPSL2Q6UWE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLPSL2Q6UWE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPSL2Q6UWE3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLPSL2Q6UWE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLPSL2Q6UWE3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLPSL2Q6UWE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLPSL2Q6UWE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLPSL2Q6UWE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms