Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms