Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEK5Q6P3R8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEK5Q6P3R8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEK5Q6P3R8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK5Q6P3R8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK5Q6P3R8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEK5Q6P3R8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK5Q6P3R8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms