Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCM7

SLC25A25, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A25Q6KCM7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC25A25Q6KCM7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC25A25Q6KCM7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC25A25Q6KCM7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC25A25Q6KCM7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A25Q6KCM7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC25A25Q6KCM7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A25Q6KCM7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC25A25Q6KCM7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms