Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIC1Q15915 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIC1Q15915 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZIC1Q15915 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZIC1Q15915 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZIC1Q15915 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZIC1Q15915 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZIC1Q15915 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZIC1Q15915 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZIC1Q15915 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIC1Q15915 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZIC1Q15915 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIC1Q15915 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZIC1Q15915 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms