Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 313.65□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 413.17□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-204ENST00000475947 598 ntTSL 212.79□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 412.79□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-201ENST00000460249 773 ntTSL 312.79□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-221ENST00000580180 753 ntTSL 211.46□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-230ENST00000584926 604 ntTSL 59.78□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-210ENST00000481898 993 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.969e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-211ENST00000483140 936 ntTSL 26.1□□□□□ -1.439e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 LRRC75A-AS1-216ENST00000492250 565 ntTSL 56.04□□□□□ -1.449e-7■■■■■ 31.8
WDR43Q15061 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 31.3
WDR43Q15061 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 311.2□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 31.3
WDR43Q15061 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)10.58□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 31.3
WDR43Q15061 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 31.3
WDR43Q15061 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 31.2
WDR43Q15061 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.721e-6■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 TUBB4B-202ENST00000604929 2035 ntTSL 1 (best)25.7■■□□□ 1.78e-7■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 11e-6■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 ACIN1-221ENST00000557432 642 ntTSL 316.24■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 ACIN1-217ENST00000555566 734 ntTSL 316■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 ACIN1-214ENST00000555352 579 ntTSL 412.6□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 ACIN1-208ENST00000553721 610 ntTSL 312.19□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 31.1
WDR43Q15061 ASIC4-205ENST00000474489 2403 ntTSL 1 (best)22.67■■□□□ 1.225e-7■■■■■ 30.5
WDR43Q15061 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.835e-7■■■■■ 30.5
WDR43Q15061 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 30.5
WDR43Q15061 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 30.3
WDR43Q15061 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 30.3
WDR43Q15061 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 30.3
WDR43Q15061 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 30.3
WDR43Q15061 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 30.3
WDR43Q15061 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 30.3
WDR43Q15061 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 29.9
WDR43Q15061 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 29.9
WDR43Q15061 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.234e-7■■■■■ 29.3
WDR43Q15061 CDK19-208ENST00000497709 1117 ntTSL 320.34■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 29.3
WDR43Q15061 CDK19-207ENST00000468997 1083 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 29.3
WDR43Q15061 CDK19-205ENST00000460913 448 ntTSL 515.89■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 29.3
WDR43Q15061 CDK19-204ENST00000457688 955 ntTSL 514.15□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 29.3
WDR43Q15061 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 29.3
WDR43Q15061 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 29.3
WDR43Q15061 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.84■■□□□ 1.571e-8■■■■■ 29.2
WDR43Q15061 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.48■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 29.2
WDR43Q15061 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 417.37■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 29.2
WDR43Q15061 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 29.2
WDR43Q15061 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 522.22■■□□□ 1.152e-19■■■■■ 28.5
WDR43Q15061 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.831e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 FGFR3-206ENST00000469068 821 ntTSL 320.69■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 28.4
WDR43Q15061 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 413.23□□□□□ -0.292e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 413.23□□□□□ -0.292e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 412.1□□□□□ -0.472e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 211.27□□□□□ -0.612e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 49.95□□□□□ -0.822e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 29.74□□□□□ -0.852e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 49.53□□□□□ -0.882e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-23■■■■■ 28
WDR43Q15061 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SMARCA1-205ENST00000617310 4291 ntTSL 213.71□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SPTAN1-206ENST00000475367 2237 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 512.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SPTAN1-210ENST00000625282 4102 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SPTAN1-215ENST00000628867 579 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)6.68□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 SMARCA1-204ENST00000478420 561 ntTSL 32.99□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 28
WDR43Q15061 ANKRD12-206ENST00000577992 390 ntTSL 330.08■■■□□ 2.413e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 225.42■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 MAPK8-210ENST00000432379 907 ntTSL 322.93■■□□□ 1.264e-7■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.013e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 MAPK8-208ENST00000426557 860 ntTSL 420.07■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 218.79■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 ANKRD12-209ENST00000585234 313 ntTSL 318.4■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 ANKRD12-204ENST00000540578 1338 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 315.27■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 ANKRD12-207ENST00000581635 631 ntTSL 414.99□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 MAPK8-207ENST00000395611 5844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 MAPK8-206ENST00000374189 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 MAPK8-209ENST00000429041 603 ntTSL 513.33□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 27.8
WDR43Q15061 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 71.5 ms