Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MDC1Q14676 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDC1Q14676 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDC1Q14676 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDC1Q14676 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MDC1Q14676 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDC1Q14676 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDC1Q14676 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDC1Q14676 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MDC1Q14676 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MDC1Q14676 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MDC1Q14676 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MDC1Q14676 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDC1Q14676 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDC1Q14676 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
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