Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MDC1Q14676 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MDC1Q14676 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
MDC1Q14676 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MDC1Q14676 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MDC1Q14676 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MDC1Q14676 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MDC1Q14676 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MDC1Q14676 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MDC1Q14676 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MDC1Q14676 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MDC1Q14676 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MDC1Q14676 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MDC1Q14676 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MDC1Q14676 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MDC1Q14676 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MDC1Q14676 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MDC1Q14676 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MDC1Q14676 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MDC1Q14676 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MDC1Q14676 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MDC1Q14676 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MDC1Q14676 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MDC1Q14676 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MDC1Q14676 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MDC1Q14676 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MDC1Q14676 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MDC1Q14676 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MDC1Q14676 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MDC1Q14676 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MDC1Q14676 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MDC1Q14676 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MDC1Q14676 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDC1Q14676 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDC1Q14676 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDC1Q14676 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MDC1Q14676 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MDC1Q14676 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MDC1Q14676 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDC1Q14676 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDC1Q14676 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDC1Q14676 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MDC1Q14676 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MDC1Q14676 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MDC1Q14676 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MDC1Q14676 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MDC1Q14676 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MDC1Q14676 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MDC1Q14676 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MDC1Q14676 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MDC1Q14676 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MDC1Q14676 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MDC1Q14676 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MDC1Q14676 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MDC1Q14676 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MDC1Q14676 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MDC1Q14676 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MDC1Q14676 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDC1Q14676 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MDC1Q14676 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MDC1Q14676 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MDC1Q14676 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDC1Q14676 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDC1Q14676 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MDC1Q14676 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MDC1Q14676 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDC1Q14676 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MDC1Q14676 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MDC1Q14676 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MDC1Q14676 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MDC1Q14676 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MDC1Q14676 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MDC1Q14676 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MDC1Q14676 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MDC1Q14676 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MDC1Q14676 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MDC1Q14676 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MDC1Q14676 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDC1Q14676 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MDC1Q14676 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MDC1Q14676 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MDC1Q14676 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MDC1Q14676 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MDC1Q14676 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MDC1Q14676 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MDC1Q14676 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MDC1Q14676 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDC1Q14676 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MDC1Q14676 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MDC1Q14676 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MDC1Q14676 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MDC1Q14676 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDC1Q14676 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MDC1Q14676 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDC1Q14676 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MDC1Q14676 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MDC1Q14676 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MDC1Q14676 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MDC1Q14676 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MDC1Q14676 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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