Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF3Q13114 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3Q13114 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3Q13114 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3Q13114 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3Q13114 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF3Q13114 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3Q13114 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3Q13114 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3Q13114 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3Q13114 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF3Q13114 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAF3Q13114 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF3Q13114 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAF3Q13114 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAF3Q13114 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAF3Q13114 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAF3Q13114 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAF3Q13114 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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