Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAF3Q13114 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAF3Q13114 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TRAF3Q13114 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAF3Q13114 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAF3Q13114 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TRAF3Q13114 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRAF3Q13114 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAF3Q13114 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAF3Q13114 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAF3Q13114 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAF3Q13114 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAF3Q13114 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAF3Q13114 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRAF3Q13114 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAF3Q13114 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRAF3Q13114 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAF3Q13114 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAF3Q13114 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAF3Q13114 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAF3Q13114 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAF3Q13114 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAF3Q13114 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAF3Q13114 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAF3Q13114 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAF3Q13114 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAF3Q13114 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAF3Q13114 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAF3Q13114 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAF3Q13114 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAF3Q13114 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAF3Q13114 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAF3Q13114 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAF3Q13114 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAF3Q13114 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAF3Q13114 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAF3Q13114 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAF3Q13114 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAF3Q13114 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAF3Q13114 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAF3Q13114 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAF3Q13114 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAF3Q13114 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAF3Q13114 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAF3Q13114 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF3Q13114 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAF3Q13114 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAF3Q13114 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAF3Q13114 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAF3Q13114 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAF3Q13114 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF3Q13114 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF3Q13114 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAF3Q13114 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAF3Q13114 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAF3Q13114 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAF3Q13114 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF3Q13114 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF3Q13114 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAF3Q13114 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF3Q13114 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAF3Q13114 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAF3Q13114 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAF3Q13114 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAF3Q13114 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAF3Q13114 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF3Q13114 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF3Q13114 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAF3Q13114 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAF3Q13114 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF3Q13114 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF3Q13114 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF3Q13114 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF3Q13114 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF3Q13114 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAF3Q13114 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAF3Q13114 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF3Q13114 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAF3Q13114 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAF3Q13114 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF3Q13114 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAF3Q13114 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAF3Q13114 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAF3Q13114 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAF3Q13114 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAF3Q13114 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAF3Q13114 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAF3Q13114 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAF3Q13114 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAF3Q13114 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF3Q13114 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAF3Q13114 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAF3Q13114 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAF3Q13114 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAF3Q13114 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF3Q13114 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAF3Q13114 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAF3Q13114 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAF3Q13114 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAF3Q13114 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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