Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MAGEC1O60732 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MAGEC1O60732 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEC1O60732 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC1O60732 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC1O60732 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC1O60732 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC1O60732 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAGEC1O60732 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC1O60732 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC1O60732 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAGEC1O60732 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MAGEC1O60732 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC1O60732 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEC1O60732 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEC1O60732 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEC1O60732 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MAGEC1O60732 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEC1O60732 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEC1O60732 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms