Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.618e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.768e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.798e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-207ENST00000537923 556 ntTSL 49.7□□□□□ -0.868e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.918e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-218ENST00000585385 976 ntTSL 58.99□□□□□ -0.978e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.118e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.128e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.128e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 PACS2-204ENST00000546915 576 ntTSL 412.24□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 83.5
RBFOX2O43251 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 83.4
RBFOX2O43251 CABLES1-210ENST00000585061 584 ntTSL 511.05□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 83.4
RBFOX2O43251 CABLES1-205ENST00000579963 2074 ntTSL 29.52□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 83.4
RBFOX2O43251 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 83.4
RBFOX2O43251 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 83.4
RBFOX2O43251 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.095e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 NR1H2-203ENST00000593532 2380 ntTSL 214.42□□□□□ -0.15e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 213.48□□□□□ -0.255e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 313.21□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 212.28□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 83.1
RBFOX2O43251 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 82.6
RBFOX2O43251 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 315.87■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 415.87■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 214.75□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 212.63□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 512.48□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 210.4□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 81.8
RBFOX2O43251 PACS2-207ENST00000548265 402 ntTSL 212.49□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 81.5
RBFOX2O43251 GRAMD4-204ENST00000431155 311 ntTSL 323.45■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 81.3
RBFOX2O43251 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 310.58□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 81.3
RBFOX2O43251 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 212.65□□□□□ -0.383e-21■■■■■ 80.7
RBFOX2O43251 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-21■■■■■ 80.7
RBFOX2O43251 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 512.22□□□□□ -0.453e-21■■■■■ 80.7
RBFOX2O43251 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.613e-21■■■■■ 80.7
RBFOX2O43251 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.713e-21■■■■■ 80.7
RBFOX2O43251 MAEA-210ENST00000508634 694 ntTSL 213.26□□□□□ -0.294e-10■■■■■ 80.3
RBFOX2O43251 KDM4C-206ENST00000438023 4022 ntTSL 511.58□□□□□ -0.561e-22■■■■■ 78.6
RBFOX2O43251 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-22■■■■■ 78.6
RBFOX2O43251 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.21e-22■■■■■ 78.6
RBFOX2O43251 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.411e-22■■■■■ 78.6
RBFOX2O43251 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.451e-22■■■■■ 78.6
RBFOX2O43251 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.641e-22■■■■■ 78.6
RBFOX2O43251 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 78.3
RBFOX2O43251 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 78.3
RBFOX2O43251 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 514.76□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 78.3
RBFOX2O43251 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 314.76□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 78.3
RBFOX2O43251 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 78.3
RBFOX2O43251 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 513.44□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 78.3
RBFOX2O43251 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 58.48□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 78.3
RBFOX2O43251 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 37.18□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 78.3
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RBFOX2O43251 ACTG1-212ENST00000576209 1698 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.877e-34■■■■■ 75.6
RBFOX2O43251 TRAF2-202ENST00000414589 680 ntTSL 310.04□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 75.4
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RBFOX2O43251 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.017e-10■■■■■ 75.3
RBFOX2O43251 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.017e-10■■■■■ 75.3
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RBFOX2O43251 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.157e-10■■■■■ 75.3
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RBFOX2O43251 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 213.22□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 75.3
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RBFOX2O43251 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 412.2□□□□□ -0.467e-10■■■■■ 75.3
RBFOX2O43251 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.787e-10■■■■■ 75.3
RBFOX2O43251 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 39.88□□□□□ -0.837e-10■■■■■ 75.3
RBFOX2O43251 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 211.2□□□□□ -0.623e-10■■■■■ 75.3
RBFOX2O43251 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 515.35■□□□□ 0.054e-10■■■■■ 74.7
RBFOX2O43251 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-10■■■■■ 74.7
RBFOX2O43251 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.854e-10■■■■■ 74.7
RBFOX2O43251 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.894e-10■■■■■ 74.7
RBFOX2O43251 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 74.5
RBFOX2O43251 NADSYN1-214ENST00000529120 574 ntTSL 512.51□□□□□ -0.416e-8■■■■■ 73.6
RBFOX2O43251 NADSYN1-203ENST00000524949 839 ntTSL 211.92□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 73.6
RBFOX2O43251 NADSYN1-213ENST00000528509 2999 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 73.6
RBFOX2O43251 NADSYN1-209ENST00000527538 720 ntTSL 311.37□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 73.6
RBFOX2O43251 NADSYN1-221ENST00000533769 559 ntTSL 411.08□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 73.6
RBFOX2O43251 NADSYN1-205ENST00000525245 603 ntTSL 58.25□□□□□ -1.096e-8■■■■■ 73.6
RBFOX2O43251 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 73.5
RBFOX2O43251 GAK-208ENST00000507124 552 ntTSL 418.32■□□□□ 0.526e-13■■■■■ 73.4
RBFOX2O43251 ABCA2-209ENST00000463603 655 ntTSL 311.81□□□□□ -0.522e-12■■■■■ 73.2
RBFOX2O43251 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 72
RBFOX2O43251 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 71.8
RBFOX2O43251 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 71.8
RBFOX2O43251 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 71.8
RBFOX2O43251 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 71.8
RBFOX2O43251 FTX-207ENST00000602576 574 ntTSL 49.41□□□□□ -0.95e-12■■■■■ 70.8
RBFOX2O43251 FTX-208ENST00000602776 561 ntTSL 43.26□□□□□ -1.895e-12■■■■■ 70.8
RBFOX2O43251 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-10■■■■■ 70.3
RBFOX2O43251 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-10■■■■■ 70.3
RBFOX2O43251 MPRIP-219ENST00000584067 3195 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 69.7
RBFOX2O43251 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 69.5
RBFOX2O43251 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 27.95□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 69.5
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