RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319023.6

NADSYN1-201, Transcript of NAD synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NADSYN1, Length 2,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NADSYN1-201ENST00000319023 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.71■■■■□ 3.15
NADSYN1-201ENST00000319023 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.19■■■□□ 2.42
NADSYN1-201ENST00000319023 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
NADSYN1-201ENST00000319023 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
NADSYN1-201ENST00000319023 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.18■■■□□ 2.26
NADSYN1-201ENST00000319023 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.11■■■□□ 2.25
NADSYN1-201ENST00000319023 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.1■■■□□ 2.25
NADSYN1-201ENST00000319023 HRCP23327 699 aa29.08■■■□□ 2.25
NADSYN1-201ENST00000319023 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.01■■■□□ 2.23
NADSYN1-201ENST00000319023 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.84■■■□□ 2.21
NADSYN1-201ENST00000319023 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
NADSYN1-201ENST00000319023 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.42■■■□□ 2.14
NADSYN1-201ENST00000319023 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.38■■■□□ 2.13
NADSYN1-201ENST00000319023 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
NADSYN1-201ENST00000319023 ABCC9O60706 1549 aa27.82■■■□□ 2.04
NADSYN1-201ENST00000319023 TRIM41Q8WV44 630 aa27.74■■■□□ 2.03
NADSYN1-201ENST00000319023 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
NADSYN1-201ENST00000319023 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
NADSYN1-201ENST00000319023 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
NADSYN1-201ENST00000319023 SCRIBQ14160 1630 aa27.57■■■□□ 2
NADSYN1-201ENST00000319023 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.44■■□□□ 1.98
NADSYN1-201ENST00000319023 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.44■■□□□ 1.98
NADSYN1-201ENST00000319023 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.14■■□□□ 1.94
NADSYN1-201ENST00000319023 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NADSYN1-201ENST00000319023 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
NADSYN1-201ENST00000319023 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.06■■□□□ 1.92
NADSYN1-201ENST00000319023 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NADSYN1-201ENST00000319023 NACADO15069 1562 aa26.92■■□□□ 1.9
NADSYN1-201ENST00000319023 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
NADSYN1-201ENST00000319023 WIZO95785 1651 aa26.89■■□□□ 1.9
NADSYN1-201ENST00000319023 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
NADSYN1-201ENST00000319023 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
NADSYN1-201ENST00000319023 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NADSYN1-201ENST00000319023 NEUROD1Q13562 356 aa26.64■■□□□ 1.86
NADSYN1-201ENST00000319023 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
NADSYN1-201ENST00000319023 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
NADSYN1-201ENST00000319023 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.55■■□□□ 1.84
NADSYN1-201ENST00000319023 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
NADSYN1-201ENST00000319023 ABCC8Q09428 1581 aa26.53■■□□□ 1.84
NADSYN1-201ENST00000319023 CEP162Q5TB80 1403 aa26.51■■□□□ 1.83
NADSYN1-201ENST00000319023 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NADSYN1-201ENST00000319023 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.44■■□□□ 1.82
NADSYN1-201ENST00000319023 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NADSYN1-201ENST00000319023 SOGA1O94964 1423 aa26.44■■□□□ 1.82
NADSYN1-201ENST00000319023 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.42■■□□□ 1.82
NADSYN1-201ENST00000319023 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
NADSYN1-201ENST00000319023 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.38■■□□□ 1.81
NADSYN1-201ENST00000319023 SMARCA2P51531 1590 aa26.33■■□□□ 1.8
NADSYN1-201ENST00000319023 SMARCA4P51532 1647 aa26.29■■□□□ 1.8
NADSYN1-201ENST00000319023 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
NADSYN1-201ENST00000319023 EEA1Q15075 1411 aa26.28■■□□□ 1.8
NADSYN1-201ENST00000319023 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.27■■□□□ 1.8
NADSYN1-201ENST00000319023 GOLGA3Q08378 1498 aa26.16■■□□□ 1.78
NADSYN1-201ENST00000319023 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NADSYN1-201ENST00000319023 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NADSYN1-201ENST00000319023 MIER1Q8N108 512 aa26■■□□□ 1.75
NADSYN1-201ENST00000319023 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.95■■□□□ 1.74
NADSYN1-201ENST00000319023 CLIP1P30622 1438 aa25.93■■□□□ 1.74
NADSYN1-201ENST00000319023 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.747e-7■■■□□ 15.1
NADSYN1-201ENST00000319023 APLP2Q06481 763 aa25.91■■□□□ 1.74
NADSYN1-201ENST00000319023 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.9■■□□□ 1.74
NADSYN1-201ENST00000319023 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.84■■□□□ 1.73
NADSYN1-201ENST00000319023 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
NADSYN1-201ENST00000319023 KIF21BO75037 1637 aa25.82■■□□□ 1.72
NADSYN1-201ENST00000319023 SYNJ1O43426 1573 aa25.82■■□□□ 1.72
NADSYN1-201ENST00000319023 MYT1Q01538 1121 aa25.81■■□□□ 1.72
NADSYN1-201ENST00000319023 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.74■■□□□ 1.71
NADSYN1-201ENST00000319023 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
NADSYN1-201ENST00000319023 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.71■■□□□ 1.71
NADSYN1-201ENST00000319023 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.66■■□□□ 1.7
NADSYN1-201ENST00000319023 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.59■■□□□ 1.69
NADSYN1-201ENST00000319023 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.56■■□□□ 1.68
NADSYN1-201ENST00000319023 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
NADSYN1-201ENST00000319023 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
NADSYN1-201ENST00000319023 TOP2BQ02880 1626 aa25.42■■□□□ 1.66
NADSYN1-201ENST00000319023 ARAP1Q96P48 1450 aa25.39■■□□□ 1.66
NADSYN1-201ENST00000319023 PRXQ9BXM0 1461 aa25.38■■□□□ 1.65
NADSYN1-201ENST00000319023 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.35■■□□□ 1.65
NADSYN1-201ENST00000319023 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
NADSYN1-201ENST00000319023 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
NADSYN1-201ENST00000319023 ITGAEP38570 1179 aa25.26■■□□□ 1.63
NADSYN1-201ENST00000319023 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.26■■□□□ 1.63
NADSYN1-201ENST00000319023 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.23■■□□□ 1.63
NADSYN1-201ENST00000319023 KIF27Q86VH2 1401 aa25.2■■□□□ 1.62
NADSYN1-201ENST00000319023 CUX2O14529 1486 aa25.17■■□□□ 1.62
NADSYN1-201ENST00000319023 CUX1P39880 1505 aa25.13■■□□□ 1.61
NADSYN1-201ENST00000319023 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.12■■□□□ 1.61
NADSYN1-201ENST00000319023 KCNH8Q96L42 1107 aa25.08■■□□□ 1.61
NADSYN1-201ENST00000319023 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.08■■□□□ 1.6
NADSYN1-201ENST00000319023 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.03■■□□□ 1.6
NADSYN1-201ENST00000319023 NCAPD3P42695 1498 aa24.98■■□□□ 1.59
NADSYN1-201ENST00000319023 MAPKBP1O60336 1514 aa24.97■■□□□ 1.59
NADSYN1-201ENST00000319023 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
NADSYN1-201ENST00000319023 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.94■■□□□ 1.58
NADSYN1-201ENST00000319023 HMGXB3Q12766 1538 aa24.93■■□□□ 1.58
NADSYN1-201ENST00000319023 CFTRP13569 1480 aa24.93■■□□□ 1.58
NADSYN1-201ENST00000319023 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.92■■□□□ 1.58
NADSYN1-201ENST00000319023 IGF1RP08069 1367 aa24.91■■□□□ 1.58
NADSYN1-201ENST00000319023 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
NADSYN1-201ENST00000319023 BCANQ96GW7 911 aa24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms