RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431155.1

GRAMD4-204, Transcript of GRAM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene GRAMD4, Length 311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4-204ENST00000431155 NISCHQ9Y2I1 1504 aa74.58■■■■■ 9.53
GRAMD4-204ENST00000431155 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa66.42■■■■■ 8.22
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC9O60706 1549 aa65.51■■■■■ 8.08
GRAMD4-204ENST00000431155 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa62.75■■■■■ 7.64
GRAMD4-204ENST00000431155 DCAF8L2P0C7V8 631 aa62.61■■■■■ 7.61
GRAMD4-204ENST00000431155 NACADO15069 1562 aa62.56■■■■■ 7.61
GRAMD4-204ENST00000431155 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.03■■■■■ 7.52
GRAMD4-204ENST00000431155 MYO15BQ96JP2 1530 aa62■■■■■ 7.52
GRAMD4-204ENST00000431155 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa61.62■■■■■ 7.45
GRAMD4-204ENST00000431155 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61.33■■■■■ 7.41
GRAMD4-204ENST00000431155 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP61.19■■■■■ 7.39
GRAMD4-204ENST00000431155 BICRAQ9NZM4 1560 aa60.9■■■■■ 7.34
GRAMD4-204ENST00000431155 SCRIBQ14160 1630 aa60.68■■■■■ 7.3
GRAMD4-204ENST00000431155 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60.51■■■■■ 7.28
GRAMD4-204ENST00000431155 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.11■■■■■ 7.21
GRAMD4-204ENST00000431155 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59.32■■■■■ 7.09
GRAMD4-204ENST00000431155 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.18■■■■■ 7.06
GRAMD4-204ENST00000431155 CECR2Q9BXF3 1484 aa58.87■■■■■ 7.01
GRAMD4-204ENST00000431155 SMARCA4P51532 1647 aa57.96■■■■■ 6.87
GRAMD4-204ENST00000431155 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP57.82■■■■■ 6.85
GRAMD4-204ENST00000431155 NCAPD3P42695 1498 aa57.75■■■■■ 6.84
GRAMD4-204ENST00000431155 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa57.75■■■■■ 6.84
GRAMD4-204ENST00000431155 SMARCA2P51531 1590 aa57.62■■■■■ 6.81
GRAMD4-204ENST00000431155 MROH2BQ7Z745 1585 aa57.52■■■■■ 6.8
GRAMD4-204ENST00000431155 HMGXB3Q12766 1538 aa57.41■■■■■ 6.78
GRAMD4-204ENST00000431155 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.35■■■■■ 6.77
GRAMD4-204ENST00000431155 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57.27■■■■■ 6.76
GRAMD4-204ENST00000431155 WIZO95785 1651 aa56.88■■■■■ 6.7
GRAMD4-204ENST00000431155 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP56.7■■■■■ 6.67
GRAMD4-204ENST00000431155 NESP48681 1621 aa56.58■■■■■ 6.65
GRAMD4-204ENST00000431155 ERCC6Q03468 1493 aa56.47■■■■■ 6.63
GRAMD4-204ENST00000431155 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56.28■■■■■ 6.6
GRAMD4-204ENST00000431155 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56.2■■■■■ 6.59
GRAMD4-204ENST00000431155 CADPSQ9ULU8 1353 aa56.07■■■■■ 6.57
GRAMD4-204ENST00000431155 CUX2O14529 1486 aa55.95■■■■■ 6.55
GRAMD4-204ENST00000431155 PDS5BQ9NTI5 1447 aa55.93■■■■■ 6.54
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa55.85■■■■■ 6.53
GRAMD4-204ENST00000431155 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP55.74■■■■■ 6.51
GRAMD4-204ENST00000431155 CFTRP13569 1480 aa55.64■■■■■ 6.5
GRAMD4-204ENST00000431155 CCDC88BA6NC98 1476 aa55.58■■■■■ 6.49
GRAMD4-204ENST00000431155 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55.44■■■■■ 6.47
GRAMD4-204ENST00000431155 MRC2Q9UBG0 1479 aa55.4■■■■■ 6.46
GRAMD4-204ENST00000431155 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.4■■■■■ 6.46
GRAMD4-204ENST00000431155 WDR62O43379 1518 aa55.22■■■■■ 6.43
GRAMD4-204ENST00000431155 PRDM2Q13029 1718 aa55.12■■■■■ 6.42
GRAMD4-204ENST00000431155 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.05■■■■■ 6.4
GRAMD4-204ENST00000431155 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP54.93■■■■■ 6.38
GRAMD4-204ENST00000431155 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.74■■■■■ 6.35
GRAMD4-204ENST00000431155 TOPBP1Q92547 1522 aa54.51■■■■■ 6.32
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC8Q09428 1581 aa54.42■■■■■ 6.3
GRAMD4-204ENST00000431155 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.39■■■■■ 6.3
GRAMD4-204ENST00000431155 IFT140Q96RY7 1462 aa54.24■■■■■ 6.27
GRAMD4-204ENST00000431155 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54.09■■■■■ 6.25
GRAMD4-204ENST00000431155 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54.03■■■■■ 6.24
GRAMD4-204ENST00000431155 CUX1P39880 1505 aa53.97■■■■■ 6.23
GRAMD4-204ENST00000431155 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP53.93■■■■■ 6.22
GRAMD4-204ENST00000431155 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.85■■■■■ 6.21
GRAMD4-204ENST00000431155 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53.84■■■■■ 6.21
GRAMD4-204ENST00000431155 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP53.83■■■■■ 6.21
GRAMD4-204ENST00000431155 SOGA1O94964 1423 aa53.8■■■■■ 6.2
GRAMD4-204ENST00000431155 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP53.74■■■■■ 6.19
GRAMD4-204ENST00000431155 OSCARQ8IYS5 282 aa53.61■■■■■ 6.17
GRAMD4-204ENST00000431155 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP53.59■■■■■ 6.17
GRAMD4-204ENST00000431155 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP53.47■■■■■ 6.15
GRAMD4-204ENST00000431155 WDR97A6NE52 1622 aa53.4■■■■■ 6.14
GRAMD4-204ENST00000431155 SYNJ1O43426 1573 aa53.38■■■■■ 6.14
GRAMD4-204ENST00000431155 TOP2BQ02880 1626 aa53.36■■■■■ 6.13
GRAMD4-204ENST00000431155 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.35■■■■■ 6.13
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.27■■■■■ 6.12
GRAMD4-204ENST00000431155 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.22■■■■■ 6.11
GRAMD4-204ENST00000431155 CHD1O14646 1710 aa53.22■■■■■ 6.11
GRAMD4-204ENST00000431155 FBLN2P98095 1184 aa53.21■■■■■ 6.11
GRAMD4-204ENST00000431155 GRIN2BQ13224 1484 aa53.2■■■■■ 6.11
GRAMD4-204ENST00000431155 GAPVD1Q14C86 1478 aa53.17■■■■■ 6.1
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.09■■■■■ 6.09
GRAMD4-204ENST00000431155 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53.07■■■■■ 6.09
GRAMD4-204ENST00000431155 PBRM1Q86U86 1689 aa53.06■■■■■ 6.09
GRAMD4-204ENST00000431155 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP52.96■■■■■ 6.07
GRAMD4-204ENST00000431155 SYNJ2O15056 1496 aa52.9■■■■■ 6.06
GRAMD4-204ENST00000431155 TRIM41Q8WV44 630 aa52.87■■■■■ 6.05
GRAMD4-204ENST00000431155 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa52.8■■■■■ 6.04
GRAMD4-204ENST00000431155 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa52.8■■■■■ 6.04
GRAMD4-204ENST00000431155 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa52.8■■■■■ 6.04
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGEF11O15085 1522 aa52.74■■■■■ 6.03
GRAMD4-204ENST00000431155 CLASP1Q7Z460 1538 aa52.63■■■■■ 6.02
GRAMD4-204ENST00000431155 ADAMTS12P58397 1594 aa52.63■■■■■ 6.02
GRAMD4-204ENST00000431155 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.61■■■■■ 6.01
GRAMD4-204ENST00000431155 GRIN2AQ12879 1464 aa52.52■■■■■ 6
GRAMD4-204ENST00000431155 FHAD1B1AJZ9 1412 aa52.52■■■■■ 6
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF27Q86VH2 1401 aa52.36■■■■■ 5.97
GRAMD4-204ENST00000431155 CYB5RLQ6IPT4 315 aa52.33■■■■■ 5.97
GRAMD4-204ENST00000431155 ARAP1Q96P48 1450 aa52.31■■■■■ 5.96
GRAMD4-204ENST00000431155 CEP170Q5SW79 1584 aa52.3■■■■■ 5.96
GRAMD4-204ENST00000431155 NUP160Q12769 1436 aa52.3■■■■■ 5.96
GRAMD4-204ENST00000431155 IGF1RP08069 1367 aa52.22■■■■■ 5.95
GRAMD4-204ENST00000431155 CUL7Q14999 1698 aa52.05■■■■■ 5.92
GRAMD4-204ENST00000431155 ERCC6L2Q5T890 1561 aa51.94■■■■■ 5.91
GRAMD4-204ENST00000431155 SHROOM2Q13796 1616 aa51.93■■■■■ 5.9
GRAMD4-204ENST00000431155 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa51.91■■■■■ 5.9
GRAMD4-204ENST00000431155 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa51.86■■■■■ 5.89
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