RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266068.5

GMEB2-201, Transcript of glucocorticoid modulatory element binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GMEB2, Length 4,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2-201ENST00000266068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.78■■□□□ 1.72
GMEB2-201ENST00000266068 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.72■■□□□ 1.23
GMEB2-201ENST00000266068 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.38■■□□□ 1.17
GMEB2-201ENST00000266068 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GMEB2-201ENST00000266068 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.89■■□□□ 1.09
GMEB2-201ENST00000266068 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
GMEB2-201ENST00000266068 ABCC9O60706 1549 aa21.04■□□□□ 0.96
GMEB2-201ENST00000266068 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.03■□□□□ 0.96
GMEB2-201ENST00000266068 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.89■□□□□ 0.93
GMEB2-201ENST00000266068 SCRIBQ14160 1630 aa20.73■□□□□ 0.91
GMEB2-201ENST00000266068 TRIM41Q8WV44 630 aa20.7■□□□□ 0.9
GMEB2-201ENST00000266068 NACADO15069 1562 aa20.6■□□□□ 0.89
GMEB2-201ENST00000266068 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GMEB2-201ENST00000266068 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.53■□□□□ 0.88
GMEB2-201ENST00000266068 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.46■□□□□ 0.87
GMEB2-201ENST00000266068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.44■□□□□ 0.86
GMEB2-201ENST00000266068 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.39■□□□□ 0.85
GMEB2-201ENST00000266068 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GMEB2-201ENST00000266068 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.31■□□□□ 0.84
GMEB2-201ENST00000266068 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
GMEB2-201ENST00000266068 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GMEB2-201ENST00000266068 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
GMEB2-201ENST00000266068 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.05■□□□□ 0.8
GMEB2-201ENST00000266068 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
GMEB2-201ENST00000266068 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GMEB2-201ENST00000266068 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
GMEB2-201ENST00000266068 HRCP23327 699 aa19.95■□□□□ 0.78
GMEB2-201ENST00000266068 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.93■□□□□ 0.78
GMEB2-201ENST00000266068 APLP2Q06481 763 aa19.92■□□□□ 0.78
GMEB2-201ENST00000266068 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
GMEB2-201ENST00000266068 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
GMEB2-201ENST00000266068 WIZO95785 1651 aa19.74■□□□□ 0.75
GMEB2-201ENST00000266068 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
GMEB2-201ENST00000266068 MYT1Q01538 1121 aa19.68■□□□□ 0.74
GMEB2-201ENST00000266068 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
GMEB2-201ENST00000266068 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.64■□□□□ 0.73
GMEB2-201ENST00000266068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
GMEB2-201ENST00000266068 SMARCA4P51532 1647 aa19.62■□□□□ 0.73
GMEB2-201ENST00000266068 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
GMEB2-201ENST00000266068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
GMEB2-201ENST00000266068 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.57■□□□□ 0.72
GMEB2-201ENST00000266068 EEA1Q15075 1411 aa19.51■□□□□ 0.71
GMEB2-201ENST00000266068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.719e-6■■■■■ 50.1
GMEB2-201ENST00000266068 SMARCA2P51531 1590 aa19.45■□□□□ 0.7
GMEB2-201ENST00000266068 ABCC8Q09428 1581 aa19.36■□□□□ 0.69
GMEB2-201ENST00000266068 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.33■□□□□ 0.69
GMEB2-201ENST00000266068 GOLGA3Q08378 1498 aa19.3■□□□□ 0.68
GMEB2-201ENST00000266068 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.28■□□□□ 0.68
GMEB2-201ENST00000266068 CEP162Q5TB80 1403 aa19.26■□□□□ 0.67
GMEB2-201ENST00000266068 SOGA1O94964 1423 aa19.25■□□□□ 0.67
GMEB2-201ENST00000266068 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
GMEB2-201ENST00000266068 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
GMEB2-201ENST00000266068 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.22■□□□□ 0.67
GMEB2-201ENST00000266068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.21■□□□□ 0.67
GMEB2-201ENST00000266068 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.21■□□□□ 0.67
GMEB2-201ENST00000266068 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
GMEB2-201ENST00000266068 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
GMEB2-201ENST00000266068 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.16■□□□□ 0.66
GMEB2-201ENST00000266068 CLIP1P30622 1438 aa19.14■□□□□ 0.66
GMEB2-201ENST00000266068 KIF27Q86VH2 1401 aa19.06■□□□□ 0.64
GMEB2-201ENST00000266068 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.02■□□□□ 0.64
GMEB2-201ENST00000266068 NCAPD3P42695 1498 aa19.02■□□□□ 0.63
GMEB2-201ENST00000266068 NEFLP07196 543 aa19.01■□□□□ 0.63
GMEB2-201ENST00000266068 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
GMEB2-201ENST00000266068 ITGAEP38570 1179 aa18.96■□□□□ 0.63
GMEB2-201ENST00000266068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.95■□□□□ 0.62
GMEB2-201ENST00000266068 HMGXB3Q12766 1538 aa18.9■□□□□ 0.62
GMEB2-201ENST00000266068 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.88■□□□□ 0.61
GMEB2-201ENST00000266068 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.85■□□□□ 0.61
GMEB2-201ENST00000266068 SYNJ1O43426 1573 aa18.84■□□□□ 0.61
GMEB2-201ENST00000266068 CUX2O14529 1486 aa18.83■□□□□ 0.6
GMEB2-201ENST00000266068 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
GMEB2-201ENST00000266068 P3H3Q8IVL6 736 aa18.81■□□□□ 0.6
GMEB2-201ENST00000266068 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.8■□□□□ 0.6
GMEB2-201ENST00000266068 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
GMEB2-201ENST00000266068 KIF21BO75037 1637 aa18.75■□□□□ 0.59
GMEB2-201ENST00000266068 CFTRP13569 1480 aa18.75■□□□□ 0.59
GMEB2-201ENST00000266068 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.74■□□□□ 0.59
GMEB2-201ENST00000266068 TOP2BQ02880 1626 aa18.73■□□□□ 0.59
GMEB2-201ENST00000266068 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
GMEB2-201ENST00000266068 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.66■□□□□ 0.58
GMEB2-201ENST00000266068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.64■□□□□ 0.58
GMEB2-201ENST00000266068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.63■□□□□ 0.57
GMEB2-201ENST00000266068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.61■□□□□ 0.57
GMEB2-201ENST00000266068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.6■□□□□ 0.57
GMEB2-201ENST00000266068 CUX1P39880 1505 aa18.59■□□□□ 0.57
GMEB2-201ENST00000266068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.58■□□□□ 0.57
GMEB2-201ENST00000266068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.57■□□□□ 0.56
GMEB2-201ENST00000266068 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
GMEB2-201ENST00000266068 PRXQ9BXM0 1461 aa18.54■□□□□ 0.56
GMEB2-201ENST00000266068 IGF1RP08069 1367 aa18.52■□□□□ 0.56
GMEB2-201ENST00000266068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.51■□□□□ 0.55
GMEB2-201ENST00000266068 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.51■□□□□ 0.55
GMEB2-201ENST00000266068 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.49■□□□□ 0.55
GMEB2-201ENST00000266068 FBLN2P98095 1184 aa18.49■□□□□ 0.55
GMEB2-201ENST00000266068 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
GMEB2-201ENST00000266068 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.48■□□□□ 0.55
GMEB2-201ENST00000266068 NEUROD1Q13562 356 aa18.47■□□□□ 0.55
GMEB2-201ENST00000266068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
GMEB2-201ENST00000266068 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms