Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 ANK1-214ENST00000524227 3825 ntTSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 TPCN1-213ENST00000550543 558 ntTSL 517.22■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DVL2-210ENST00000575756 1136 ntTSL 526.76■■□□□ 1.871e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DVL2-203ENST00000572285 1240 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DVL2-205ENST00000574143 992 ntTSL 317.56■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DVL2-212ENST00000576439 579 ntTSL 314.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 HDAC6-218ENST00000470942 668 ntTSL 319.01■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 HDAC6-236ENST00000498808 566 ntTSL 518.7■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 PFAS-202ENST00000546020 2652 ntTSL 218.68■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 HDAC6-232ENST00000489053 539 ntTSL 411.08□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 HDAC6-223ENST00000480525 412 ntTSL 36.19□□□□□ -1.424e-7■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 CSMD1-201ENST00000335551 12134 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DPY19L4-204ENST00000520774 581 ntTSL 529.9■■■□□ 2.381e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DPY19L4-206ENST00000522422 680 ntTSL 329.31■■■□□ 2.281e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DPY19L4-202ENST00000519176 1124 ntTSL 58.73□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 DPY19L4-203ENST00000519353 340 ntTSL 34.85□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 29.1
DDX24Q9GZR7 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 416.82■□□□□ 0.287e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 55.69□□□□□ -1.57e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 55.52□□□□□ -1.537e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 55.32□□□□□ -1.567e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 217.49■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-205ENST00000547670 1866 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-202ENST00000417750 2334 ntTSL 218.54■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-216ENST00000550867 2800 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-227ENST00000552577 2083 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.341e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LIME1-207ENST00000489212 559 ntTSL 525.6■■□□□ 1.691e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LIME1-204ENST00000476183 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.6■■□□□ 1.691e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.551e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.421e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 DGKQ-205ENST00000515182 479 ntTSL 520.98■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 LIME1-208ENST00000493265 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.8■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 MMP17-202ENST00000534865 1510 ntTSL 320.68■□□□□ 0.91e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 MMP17-204ENST00000535182 659 ntTSL 219.98■□□□□ 0.791e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 MMP17-208ENST00000542142 758 ntTSL 418.96■□□□□ 0.631e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 SEC23A-212ENST00000556092 571 ntTSL 417.05■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 CABIN1-210ENST00000484593 561 ntTSL 312.86□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ACSS2-223ENST00000494727 1030 ntTSL 211.97□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 SEC23A-210ENST00000555425 547 ntTSL 55.82□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 KIAA1109-210ENST00000449251 492 ntTSL 34.27□□□□□ -1.731e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 KIAA1109-213ENST00000482114 4096 ntTSL 1 (best)3.85□□□□□ -1.791e-9■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 SEC23A-208ENST00000555017 588 ntTSL 43.72□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.599e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.539e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 224.56■■□□□ 1.529e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)24.43■■□□□ 1.59e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 224.34■■□□□ 1.499e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.429e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 222.97■■□□□ 1.279e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.19e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.089e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.039e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.989e-7■■■■■ 29
DDX24Q9GZR7 ACADVL-221ENST00000579886 502 ntTSL 524.99■■□□□ 1.591e-11■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 ACADVL-207ENST00000577433 803 ntTSL 218.37■□□□□ 0.531e-11■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 ACADVL-228ENST00000582166 550 ntTSL 414□□□□□ -0.171e-11■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 NBEAL2-210ENST00000477412 827 ntTSL 219.28■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 MYO19-209ENST00000612097 580 ntTSL 511.47□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 TSC2-211ENST00000467949 590 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 520.88■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 DDX11-221ENST00000542661 562 ntTSL 517.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 BIRC6-209ENST00000471232 4226 ntTSL 27.75□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 FANCA-208ENST00000561722 696 ntTSL 314.98□□□□□ -0.019e-10■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 FANCA-209ENST00000562424 745 ntTSL 213.92□□□□□ -0.189e-10■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)28.65■■■□□ 2.185e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.145e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 LTBP3-220ENST00000532661 748 ntTSL 327.82■■■□□ 2.042e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.945e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.934e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.934e-6■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.565e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.555e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.495e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 PKMYT1-202ENST00000382240 1991 ntTSL 224.25■■□□□ 1.475e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.395e-9■■■■■ 28.9
DDX24Q9GZR7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.145e-9■■■■■ 28.9
Retrieved 100 of 28,409 protein–RNA pairs in 327.1 ms