RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532661.5

LTBP3-220, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene LTBP3, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3-220ENST00000532661 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.05■■■■■ 6.72
LTBP3-220ENST00000532661 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.9■■■■■ 5.74
LTBP3-220ENST00000532661 ABCC9O60706 1549 aa50.68■■■■■ 5.7
LTBP3-220ENST00000532661 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.31■■■■■ 5.32
LTBP3-220ENST00000532661 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.12■■■■■ 5.29
LTBP3-220ENST00000532661 NACADO15069 1562 aa48.08■■■■■ 5.29
LTBP3-220ENST00000532661 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.52■■■■■ 5.2
LTBP3-220ENST00000532661 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
LTBP3-220ENST00000532661 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.33■■■■■ 5.172e-8■■■□□ 15.2
LTBP3-220ENST00000532661 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.28■■■■■ 5.16
LTBP3-220ENST00000532661 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.19■■■■■ 5.14
LTBP3-220ENST00000532661 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.09■■■■■ 5.13
LTBP3-220ENST00000532661 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.95■■■■■ 5.11
LTBP3-220ENST00000532661 SCRIBQ14160 1630 aa46.52■■■■■ 5.04
LTBP3-220ENST00000532661 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.24■■■■■ 4.99
LTBP3-220ENST00000532661 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
LTBP3-220ENST00000532661 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.74■■■■■ 4.91
LTBP3-220ENST00000532661 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.58■■■■■ 4.89
LTBP3-220ENST00000532661 NCAPD3P42695 1498 aa44.44■■■■■ 4.7
LTBP3-220ENST00000532661 SMARCA4P51532 1647 aa44.39■■■■■ 4.7
LTBP3-220ENST00000532661 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.38■■■■■ 4.69
LTBP3-220ENST00000532661 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
LTBP3-220ENST00000532661 SMARCA2P51531 1590 aa44.21■■■■■ 4.67
LTBP3-220ENST00000532661 HMGXB3Q12766 1538 aa44.09■■■■■ 4.65
LTBP3-220ENST00000532661 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.01■■■■■ 4.64
LTBP3-220ENST00000532661 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
LTBP3-220ENST00000532661 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.92■■■■■ 4.62
LTBP3-220ENST00000532661 ERCC6Q03468 1493 aa43.68■■■■■ 4.58
LTBP3-220ENST00000532661 NESP48681 1621 aa43.67■■■■■ 4.58
LTBP3-220ENST00000532661 WIZO95785 1651 aa43.46■■■■■ 4.55
LTBP3-220ENST00000532661 CUX2O14529 1486 aa43.42■■■■■ 4.54
LTBP3-220ENST00000532661 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.31■■■■■ 4.52
LTBP3-220ENST00000532661 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
LTBP3-220ENST00000532661 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.14■■■■■ 4.5
LTBP3-220ENST00000532661 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.09■■■■■ 4.49
LTBP3-220ENST00000532661 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
LTBP3-220ENST00000532661 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.03■■■■■ 4.48
LTBP3-220ENST00000532661 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.02■■■■■ 4.48
LTBP3-220ENST00000532661 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
LTBP3-220ENST00000532661 CFTRP13569 1480 aa42.7■■■■■ 4.43
LTBP3-220ENST00000532661 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.7■■■■■ 4.43
LTBP3-220ENST00000532661 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.62■■■■■ 4.41
LTBP3-220ENST00000532661 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.62■■■■■ 4.41
LTBP3-220ENST00000532661 WDR62O43379 1518 aa42.56■■■■■ 4.4
LTBP3-220ENST00000532661 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.49■■■■■ 4.39
LTBP3-220ENST00000532661 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
LTBP3-220ENST00000532661 PRDM2Q13029 1718 aa42.15■■■■■ 4.34
LTBP3-220ENST00000532661 TOPBP1Q92547 1522 aa41.86■■■■■ 4.29
LTBP3-220ENST00000532661 IFT140Q96RY7 1462 aa41.74■■■■■ 4.27
LTBP3-220ENST00000532661 ABCC8Q09428 1581 aa41.74■■■■■ 4.27
LTBP3-220ENST00000532661 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
LTBP3-220ENST00000532661 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
LTBP3-220ENST00000532661 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.71■■■■■ 4.27
LTBP3-220ENST00000532661 OSCARQ8IYS5 282 aa41.59■■■■■ 4.25
LTBP3-220ENST00000532661 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
LTBP3-220ENST00000532661 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
LTBP3-220ENST00000532661 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
LTBP3-220ENST00000532661 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.4■■■■■ 4.22
LTBP3-220ENST00000532661 TRIM41Q8WV44 630 aa41.37■■■■■ 4.21
LTBP3-220ENST00000532661 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.36■■■■■ 4.21
LTBP3-220ENST00000532661 SOGA1O94964 1423 aa41.31■■■■■ 4.2
LTBP3-220ENST00000532661 CUX1P39880 1505 aa41.31■■■■■ 4.2
LTBP3-220ENST00000532661 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.28■■■■■ 4.2
LTBP3-220ENST00000532661 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
LTBP3-220ENST00000532661 FBLN2P98095 1184 aa41.06■■■■■ 4.16
LTBP3-220ENST00000532661 CHD1O14646 1710 aa41■■■■■ 4.15
LTBP3-220ENST00000532661 WDR97A6NE52 1622 aa40.95■■■■■ 4.15
LTBP3-220ENST00000532661 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.95■■■■■ 4.15
LTBP3-220ENST00000532661 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.95■■■■■ 4.15
LTBP3-220ENST00000532661 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.95■■■■■ 4.15
LTBP3-220ENST00000532661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.95■■■■■ 4.15
LTBP3-220ENST00000532661 ARHGEF11O15085 1522 aa40.88■■■■■ 4.14
LTBP3-220ENST00000532661 GRIN2BQ13224 1484 aa40.87■■■■■ 4.13
LTBP3-220ENST00000532661 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.8■■■■■ 4.12
LTBP3-220ENST00000532661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.8■■■■■ 4.12
LTBP3-220ENST00000532661 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
LTBP3-220ENST00000532661 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
LTBP3-220ENST00000532661 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
LTBP3-220ENST00000532661 SYNJ1O43426 1573 aa40.71■■■■■ 4.11
LTBP3-220ENST00000532661 TOP2BQ02880 1626 aa40.7■■■■■ 4.11
LTBP3-220ENST00000532661 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.68■■■■■ 4.1
LTBP3-220ENST00000532661 SYNJ2O15056 1496 aa40.68■■■■■ 4.1
LTBP3-220ENST00000532661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.67■■■■■ 4.1
LTBP3-220ENST00000532661 PBRM1Q86U86 1689 aa40.66■■■■■ 4.1
LTBP3-220ENST00000532661 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.64■■■■■ 4.1
LTBP3-220ENST00000532661 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.57■■■■■ 4.09
LTBP3-220ENST00000532661 ARAP1Q96P48 1450 aa40.53■■■■■ 4.08
LTBP3-220ENST00000532661 GRIN2AQ12879 1464 aa40.35■■■■■ 4.05
LTBP3-220ENST00000532661 ADAMTS12P58397 1594 aa40.35■■■■■ 4.05
LTBP3-220ENST00000532661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.29■■■■■ 4.04
LTBP3-220ENST00000532661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.04
LTBP3-220ENST00000532661 NUP160Q12769 1436 aa40.2■■■■■ 4.03
LTBP3-220ENST00000532661 CEP170Q5SW79 1584 aa40.18■■■■■ 4.02
LTBP3-220ENST00000532661 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.06■■■■■ 4
LTBP3-220ENST00000532661 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
LTBP3-220ENST00000532661 KIF27Q86VH2 1401 aa39.96■■■■□ 3.99
LTBP3-220ENST00000532661 IGF1RP08069 1367 aa39.95■■■■□ 3.99
LTBP3-220ENST00000532661 SHROOM2Q13796 1616 aa39.92■■■■□ 3.98
LTBP3-220ENST00000532661 JPH4Q96JJ6 628 aa39.85■■■■□ 3.97
LTBP3-220ENST00000532661 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
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