Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-203ENST00000356456 726 ntTSL 321.93■■□□□ 1.14e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-205ENST00000412146 553 ntTSL 318.47■□□□□ 0.554e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 FAM53A-206ENST00000489029 628 ntTSL 317.24■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.254e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.46e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.464e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.486e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-201ENST00000319849 596 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 NEAT1_3.1-201ENST00000613347 159 ntBASIC11.1□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-206ENST00000429434 1945 ntTSL 210.21□□□□□ -0.784e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-209ENST00000484377 695 ntTSL 28.7□□□□□ -1.024e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-204ENST00000392041 529 ntTSL 48.65□□□□□ -1.024e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-206ENST00000468874 724 ntTSL 57.5□□□□□ -1.214e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 USP33-209ENST00000481579 2866 ntTSL 25.19□□□□□ -1.586e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 ZNF140-209ENST00000536790 2328 ntTSL 1 (best)5.02□□□□□ -1.614e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.856e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-207ENST00000470682 364 ntTSL 53.17□□□□□ -1.94e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 CDK6-204ENST00000473078 386 ntTSL 21.96□□□□□ -2.14e-9■■■■■ 29.6
TARDBPQ13148 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-16■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 LTBP1-206ENST00000415140 799 ntTSL 510.41□□□□□ -0.742e-16■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 LTBP1-208ENST00000422669 810 ntTSL 59.23□□□□□ -0.932e-16■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.072e-16■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.082e-16■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-16■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 513.52□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.382e-8■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 MTX2-205ENST00000452865 817 ntTSL 323.66■■□□□ 1.382e-8■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 MTX2-203ENST00000423461 618 ntTSL 323.29■■□□□ 1.322e-8■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 MTX2-202ENST00000420864 1592 ntTSL 1 (best)20.83■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.875e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.675e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.495e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.495e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.145e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.145e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-207ENST00000468924 912 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.095e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 YBEY-208ENST00000492864 1402 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-14■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.16e-9■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.616e-9■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.966e-9■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.526e-9■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.526e-9■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 EXO1-211ENST00000521202 628 ntTSL 54.49□□□□□ -1.696e-9■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 29.5
TARDBPQ13148 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 29.4
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TARDBPQ13148 YAF2-205ENST00000546726 580 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 UFM1-204ENST00000464423 585 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 UFM1-205ENST00000494372 777 ntTSL 26.97□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 UFM1-203ENST00000437952 639 ntTSL 36.2□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 ADGRV1-235ENST00000640729 1360 ntTSL 59.34□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 ADGRV1-234ENST00000640464 4505 ntTSL 54.91□□□□□ -1.623e-6■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 SLC6A6-205ENST00000613930 988 ntTSL 218.91■□□□□ 0.621e-10■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-10■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 217.61■□□□□ 0.411e-10■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 SLC6A6-206ENST00000615188 689 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 SLC6A6-209ENST00000622176 1116 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.291e-10■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 DPY19L3-207ENST00000588648 3589 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-8■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PPP2R5C-207ENST00000553730 1227 ntTSL 219.66■□□□□ 0.747e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PPP2R5C-219ENST00000556307 601 ntTSL 34.87□□□□□ -1.637e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.623e-8■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 BACH1-204ENST00000435072 692 ntTSL 312.29□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 BACH1-205ENST00000447177 751 ntTSL 211.74□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 BACH1-206ENST00000451655 777 ntTSL 38.38□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 LINC00355-201ENST00000456627 1878 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 213.07□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 29.4
TARDBPQ13148 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 214.53□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.898e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.398e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 517.11■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 29.3
TARDBPQ13148 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 29.3
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