Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYH13Q9UKX3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYH13Q9UKX3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYH13Q9UKX3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYH13Q9UKX3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH13Q9UKX3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH13Q9UKX3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYH13Q9UKX3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MYH13Q9UKX3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYH13Q9UKX3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYH13Q9UKX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYH13Q9UKX3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYH13Q9UKX3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MYH13Q9UKX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYH13Q9UKX3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
MYH13Q9UKX3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MYH13Q9UKX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.81■■■■□ 3
MYH13Q9UKX3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MYH13Q9UKX3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MYH13Q9UKX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MYH13Q9UKX3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MYH13Q9UKX3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
MYH13Q9UKX3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MYH13Q9UKX3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MYH13Q9UKX3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MYH13Q9UKX3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
MYH13Q9UKX3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MYH13Q9UKX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MYH13Q9UKX3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MYH13Q9UKX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MYH13Q9UKX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
MYH13Q9UKX3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
MYH13Q9UKX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH13Q9UKX3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MYH13Q9UKX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MYH13Q9UKX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MYH13Q9UKX3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MYH13Q9UKX3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MYH13Q9UKX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
MYH13Q9UKX3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MYH13Q9UKX3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYH13Q9UKX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYH13Q9UKX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MYH13Q9UKX3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MYH13Q9UKX3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MYH13Q9UKX3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MYH13Q9UKX3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MYH13Q9UKX3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MYH13Q9UKX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYH13Q9UKX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
MYH13Q9UKX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MYH13Q9UKX3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms