Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD3Q9NZN3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD3Q9NZN3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EHD3Q9NZN3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD3Q9NZN3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD3Q9NZN3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD3Q9NZN3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD3Q9NZN3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD3Q9NZN3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD3Q9NZN3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EHD3Q9NZN3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD3Q9NZN3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD3Q9NZN3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD3Q9NZN3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD3Q9NZN3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD3Q9NZN3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD3Q9NZN3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EHD3Q9NZN3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EHD3Q9NZN3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD3Q9NZN3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD3Q9NZN3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD3Q9NZN3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms