Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB9BQ9NP90 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB9BQ9NP90 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB9BQ9NP90 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB9BQ9NP90 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB9BQ9NP90 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB9BQ9NP90 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB9BQ9NP90 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB9BQ9NP90 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB9BQ9NP90 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB9BQ9NP90 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB9BQ9NP90 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB9BQ9NP90 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB9BQ9NP90 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms