Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB9BQ9NP90 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB9BQ9NP90 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB9BQ9NP90 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB9BQ9NP90 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB9BQ9NP90 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB9BQ9NP90 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB9BQ9NP90 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB9BQ9NP90 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB9BQ9NP90 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB9BQ9NP90 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB9BQ9NP90 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAB9BQ9NP90 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB9BQ9NP90 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB9BQ9NP90 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB9BQ9NP90 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB9BQ9NP90 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB9BQ9NP90 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB9BQ9NP90 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB9BQ9NP90 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB9BQ9NP90 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB9BQ9NP90 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB9BQ9NP90 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB9BQ9NP90 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB9BQ9NP90 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB9BQ9NP90 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB9BQ9NP90 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB9BQ9NP90 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB9BQ9NP90 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB9BQ9NP90 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB9BQ9NP90 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB9BQ9NP90 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB9BQ9NP90 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB9BQ9NP90 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB9BQ9NP90 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB9BQ9NP90 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB9BQ9NP90 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB9BQ9NP90 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB9BQ9NP90 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB9BQ9NP90 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB9BQ9NP90 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB9BQ9NP90 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB9BQ9NP90 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB9BQ9NP90 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB9BQ9NP90 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB9BQ9NP90 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB9BQ9NP90 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB9BQ9NP90 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB9BQ9NP90 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB9BQ9NP90 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB9BQ9NP90 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB9BQ9NP90 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB9BQ9NP90 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB9BQ9NP90 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB9BQ9NP90 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB9BQ9NP90 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB9BQ9NP90 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB9BQ9NP90 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB9BQ9NP90 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB9BQ9NP90 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB9BQ9NP90 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB9BQ9NP90 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB9BQ9NP90 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB9BQ9NP90 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB9BQ9NP90 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB9BQ9NP90 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB9BQ9NP90 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB9BQ9NP90 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB9BQ9NP90 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB9BQ9NP90 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB9BQ9NP90 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB9BQ9NP90 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB9BQ9NP90 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB9BQ9NP90 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB9BQ9NP90 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB9BQ9NP90 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB9BQ9NP90 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB9BQ9NP90 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB9BQ9NP90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB9BQ9NP90 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB9BQ9NP90 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB9BQ9NP90 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB9BQ9NP90 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB9BQ9NP90 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB9BQ9NP90 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB9BQ9NP90 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB9BQ9NP90 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB9BQ9NP90 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB9BQ9NP90 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB9BQ9NP90 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB9BQ9NP90 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB9BQ9NP90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms