Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STK35Q8TDR2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STK35Q8TDR2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STK35Q8TDR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STK35Q8TDR2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STK35Q8TDR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STK35Q8TDR2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STK35Q8TDR2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STK35Q8TDR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STK35Q8TDR2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STK35Q8TDR2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STK35Q8TDR2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STK35Q8TDR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STK35Q8TDR2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STK35Q8TDR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STK35Q8TDR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STK35Q8TDR2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STK35Q8TDR2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STK35Q8TDR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STK35Q8TDR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms