Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET8

TRPV3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV3Q8NET8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRPV3Q8NET8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRPV3Q8NET8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPV3Q8NET8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPV3Q8NET8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPV3Q8NET8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPV3Q8NET8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPV3Q8NET8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRPV3Q8NET8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRPV3Q8NET8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRPV3Q8NET8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRPV3Q8NET8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPV3Q8NET8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPV3Q8NET8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPV3Q8NET8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPV3Q8NET8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRPV3Q8NET8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPV3Q8NET8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRPV3Q8NET8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRPV3Q8NET8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPV3Q8NET8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRPV3Q8NET8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPV3Q8NET8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms