Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
WDR44Q5JSH3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
WDR44Q5JSH3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
WDR44Q5JSH3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
WDR44Q5JSH3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
WDR44Q5JSH3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
WDR44Q5JSH3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
WDR44Q5JSH3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
WDR44Q5JSH3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
WDR44Q5JSH3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
WDR44Q5JSH3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
WDR44Q5JSH3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
WDR44Q5JSH3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WDR44Q5JSH3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WDR44Q5JSH3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
WDR44Q5JSH3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms