Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
WDR44Q5JSH3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
WDR44Q5JSH3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
WDR44Q5JSH3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
WDR44Q5JSH3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
WDR44Q5JSH3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
WDR44Q5JSH3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
WDR44Q5JSH3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
WDR44Q5JSH3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
WDR44Q5JSH3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
WDR44Q5JSH3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
WDR44Q5JSH3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
WDR44Q5JSH3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
WDR44Q5JSH3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
WDR44Q5JSH3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
WDR44Q5JSH3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
WDR44Q5JSH3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
WDR44Q5JSH3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
WDR44Q5JSH3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
WDR44Q5JSH3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
WDR44Q5JSH3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
WDR44Q5JSH3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WDR44Q5JSH3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
WDR44Q5JSH3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
WDR44Q5JSH3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
WDR44Q5JSH3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
WDR44Q5JSH3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
WDR44Q5JSH3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
WDR44Q5JSH3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WDR44Q5JSH3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
WDR44Q5JSH3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
WDR44Q5JSH3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
WDR44Q5JSH3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
WDR44Q5JSH3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
WDR44Q5JSH3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
WDR44Q5JSH3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
WDR44Q5JSH3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
WDR44Q5JSH3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
WDR44Q5JSH3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
WDR44Q5JSH3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
WDR44Q5JSH3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
WDR44Q5JSH3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
WDR44Q5JSH3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
WDR44Q5JSH3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
WDR44Q5JSH3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
WDR44Q5JSH3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
WDR44Q5JSH3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
WDR44Q5JSH3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
WDR44Q5JSH3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
WDR44Q5JSH3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
WDR44Q5JSH3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
WDR44Q5JSH3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
WDR44Q5JSH3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
WDR44Q5JSH3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
WDR44Q5JSH3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
WDR44Q5JSH3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
WDR44Q5JSH3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
WDR44Q5JSH3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
WDR44Q5JSH3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
WDR44Q5JSH3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
WDR44Q5JSH3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
WDR44Q5JSH3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
WDR44Q5JSH3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
WDR44Q5JSH3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
WDR44Q5JSH3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
WDR44Q5JSH3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
WDR44Q5JSH3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
WDR44Q5JSH3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
WDR44Q5JSH3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
WDR44Q5JSH3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
WDR44Q5JSH3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
WDR44Q5JSH3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
WDR44Q5JSH3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
WDR44Q5JSH3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
WDR44Q5JSH3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
WDR44Q5JSH3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
WDR44Q5JSH3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
WDR44Q5JSH3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
WDR44Q5JSH3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
WDR44Q5JSH3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
WDR44Q5JSH3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
WDR44Q5JSH3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
WDR44Q5JSH3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
WDR44Q5JSH3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
WDR44Q5JSH3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
WDR44Q5JSH3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
WDR44Q5JSH3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
WDR44Q5JSH3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
WDR44Q5JSH3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
WDR44Q5JSH3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
WDR44Q5JSH3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
WDR44Q5JSH3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
WDR44Q5JSH3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
WDR44Q5JSH3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
WDR44Q5JSH3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
WDR44Q5JSH3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
WDR44Q5JSH3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
WDR44Q5JSH3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
WDR44Q5JSH3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms