Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms