Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL23Q16540 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL23Q16540 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRPL23Q16540 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRPL23Q16540 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL23Q16540 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL23Q16540 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRPL23Q16540 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MRPL23Q16540 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MRPL23Q16540 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRPL23Q16540 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MRPL23Q16540 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL23Q16540 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL23Q16540 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MRPL23Q16540 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL23Q16540 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRPL23Q16540 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRPL23Q16540 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL23Q16540 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRPL23Q16540 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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