Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 NOL3-212ENST00000568199 613 ntTSL 319.07■□□□□ 0.648e-9■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.597e-7■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.497e-7■■■■□ 20.8
SAFBQ15424 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.262e-6■■■■□ 20.7
SAFBQ15424 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-6■■■■□ 20.7
SAFBQ15424 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 20.7
SAFBQ15424 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 20.7
SAFBQ15424 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.826e-7■■■■□ 20.7
SAFBQ15424 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 12e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 516.54■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 410.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 FREM1-205ENST00000427623 1421 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 FREM1-208ENST00000486223 815 ntTSL 33.18□□□□□ -1.92e-6■■■■□ 20.6
SAFBQ15424 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 20.4
SAFBQ15424 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.931e-11■■■■□ 20.4
SAFBQ15424 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 219.22■□□□□ 0.671e-11■■■■□ 20.4
SAFBQ15424 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 212.46□□□□□ -0.411e-11■■■■□ 20.4
SAFBQ15424 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 511.6□□□□□ -0.551e-11■■■■□ 20.4
SAFBQ15424 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.661e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)29.75■■■□□ 2.351e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 529.62■■■□□ 2.331e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 528.69■■■□□ 2.181e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 528.6■■■□□ 2.171e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.091e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 527.09■■□□□ 1.931e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 524.41■■□□□ 1.51e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 224.14■■□□□ 1.451e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 323.83■■□□□ 1.411e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 523.03■■□□□ 1.281e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 520.37■□□□□ 0.851e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 319.96■□□□□ 0.791e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.421e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 516.96■□□□□ 0.311e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 516.84■□□□□ 0.291e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 315.86■□□□□ 0.131e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 512.09□□□□□ -0.471e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 311.39□□□□□ -0.591e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.38□□□□□ -0.591e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.38□□□□□ -0.591e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.611e-17■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 UBR5-205ENST00000519365 602 ntTSL 36.72□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 UBR5-208ENST00000520898 582 ntTSL 35.51□□□□□ -1.531e-6■■■■□ 20.2
SAFBQ15424 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 20.1
SAFBQ15424 NEDD9-214ENST00000513989 587 ntTSL 411.69□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 20.1
SAFBQ15424 NEDD9-211ENST00000508546 581 ntTSL 510.19□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 20.1
SAFBQ15424 NEDD9-203ENST00000397378 470 ntTSL 310.19□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 20.1
SAFBQ15424 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-6■■■■□ 20
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SAFBQ15424 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 20
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SAFBQ15424 CLASP2-214ENST00000480385 614 ntTSL 56.5□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 20
SAFBQ15424 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-6■■■■□ 20
SAFBQ15424 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.156e-6■■■■□ 19.9
SAFBQ15424 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.933e-6■■■■□ 19.7
SAFBQ15424 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.843e-6■■■■□ 19.7
SAFBQ15424 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 19.7
SAFBQ15424 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 516.45■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 19.7
SAFBQ15424 PAPD7-206ENST00000515721 603 ntTSL 330.69■■■□□ 2.53e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.53e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.242e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 522.75■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 219.2■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.644e-6■■■■□ 19.6
SAFBQ15424 DENND4A-208ENST00000568515 2655 ntTSL 224.64■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 19.4
SAFBQ15424 DENND4A-206ENST00000564674 3389 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.952e-6■■■■□ 19.4
SAFBQ15424 AC011939.1-201ENST00000567680 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 19.4
SAFBQ15424 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 19.4
SAFBQ15424 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.932e-6■■■■□ 19.4
SAFBQ15424 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 14e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.974e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.884e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.674e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.64e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.14e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 RAPGEF5-209ENST00000475788 728 ntTSL 313.37□□□□□ -0.274e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.454e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 510.54□□□□□ -0.724e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 58.14□□□□□ -1.114e-6■■■□□ 19.1
SAFBQ15424 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.194e-6■■■□□ 19.1
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